本实用新型公开了一种沙葱种子清选系统，其包括料仓、振动筛、去石机、碾米机、风筛清选机、比重精选机和色选机；振动筛的出料口与去石机的进料口通过斗提机连接；去石机的出料口与碾米机的进料口通过斗提机连接；碾米机的出料口与风筛清选机的进料口通过斗提机连接，风筛清选机的出料口与比重精选机的进料口通过斗提机连接，比重精选机的出料口与色选机的进料口通过斗提机连接。优点：本实用新型结构简单，易实现，最后得到干净质量较好的沙葱种子，有效的提高了其质量品质；本实用新型清选系统，实现了处理沙葱种子系统一体化，使得处理种子的效率提高，能够快速大量处理种子，提高了企业的经济效益。