本实用新型公开了一种适用于湖泊治理的藻水分离装置，属于湖泊治理装置技术领域，其包括装置主体，所述装置主体内壁的右侧面与脱水箱的左侧面固定连接，所述脱水箱内壁的左右两侧面通过轴承活动连接有同一个锥形螺旋桨，所述脱水箱内壁的下表面卡接有过水网。该适用于湖泊治理的藻水分离装置，通过设置有脱水箱、烘干风扇和第一过滤网，通过锥形螺旋桨的传送对水藻进行挤压，水从过水网经过导流板流入到蓄水箱内，随后水藻掉落到烘干箱内，烘干风扇与电热阻丝产生热风吹向水藻，通过破碎搅拌叶片对水藻进行破碎增加与热风的接触面积，从而提高烘干效率，通过水藻进行烘干防止水藻发生腐烂，便于储存和后期的回收利用。