本实用新型公开了一种水土环境共用的13CO2标记培养‑根系分泌物收集装置，包括上部的同位素气体标记箱和下部植物根箱两大部分，标记箱包含玻璃罩、空气混合装置和配有气阀的13CO2气瓶，植物根箱自左向右由PVC塑料板分隔成左溶液培养室和右土壤培养室，在右土培室中由尼龙网将土壤分隔成若干个纵向隔层，每个分隔的根系生长室中埋入Micro Rhizon根际溶液采样器。本实用新型提供的水土环境共用的植物13CO2标记根系分泌物收集装置具有结构简单、占地面积小和成本低的特点，能够在不破坏根系生长的前提下实现将土壤自身的有机物与根系分泌物分开，并精确定位收集和分析不同根际微域中根系分泌物的分布特征。