一种复合垂直流人工湿地滤料振动筛分跨池传送分层填筑系统，包括通过隔墙分隔形成单元池，单元池包括一组先施工单元行和一组后施工单元行，后施工单元行的纵向的隔墙上开有施工豁口，施工豁口上固定连接有横穿后施工单元行的便道，便道上设有行走的滤料装载装置和静止的滤料转运装置，便道朝向先施工单元行一侧的池底上设有振动筛分装置，振动筛分装置的出料口朝向先施工单元行一侧设有传送带结构，传送带单元在隔墙位置横跨隔墙。本实用新型是将各层填料，先经筛分装置筛分除去石粉及小粒径碎屑，提高滤料级洁净度及粒径均匀性，然后直接经传送带分级多阶跨池传送至填筑部位，有效的保证滤料的通透性及滤水净化性能。