本实用新型公开了一种用于湖泊治理的藻水分离装置，包括对称设置的浮块，所述浮块的底部设有连接浮块的方筒，所述方筒的底部连通设有锥形筒，所述锥形筒的底部设有储电池，所述锥形筒的两侧分别设有对称设置的管体一和管体二，所述方筒内设有延伸进锥形筒内且与管体一相配合的斜板，所述管体一远离锥形筒的一端设有水泵，所述管体一内设有弧形板，所述管体一的外侧设有减速电机，所述减速电机的输出端设有伸入管体一内的转轴，所述转轴上设有与弧形板相配合的叶片，所述管体二内设有电机，所述电机的输出端设有扇叶，所述管体二远离锥形筒的一端设有可拆卸的收集网。本实用新型的优点在于：可以对水中的藻类进行快速收集，并将藻类和分离开来。