本实用新型公开了一种竖向多料仓餐厨垃圾分步微生物处理设备，该设备包含：箱体，其开设有进料口和出料口；至少两个反应仓，各个所述反应仓在箱体内沿竖向依次分布，各个所述反应仓之间设置有隔离板，所述隔离板包含电磁控制阀门；搅拌装置，其设置于各个反应仓内；驱动装置，其与所述搅拌装置连接以驱动所述搅拌装置转动。其优点是：该设备将箱体、反应仓、电磁控制阀门、搅拌装置等相结合，各反应仓之间竖向排列，通过包含电磁控制阀门的隔离板将各个反应仓之间隔绝开，各反应仓之间互不干扰、分步进行，以便餐厨垃圾更为充分地反应，该设备能够有效地避免后加入的餐厨垃圾对先加入的已经反应的餐厨垃圾的影响，实现了餐厨垃圾的分步处理。