本实用新型公开了一种果树花粉分离装置，涉及花粉分离技术领域。第一壳体、第二壳体以及设置在第一壳体中的驱动打散组件；第一壳体设置在第二壳体的上方并与第二壳体连接，第一壳体与第二壳体的连接位置设置有用于排出废渣的排料间隙；第一壳体的顶部设置有进料口，驱动打散组件竖直设置在第一壳体中，第二壳体中设置有筛出花粉颗粒并将杂质从排料间隙排出的转动筛粉组件，转动筛粉组件的顶部伸入到第一壳体中，转动筛粉组件的底部与第二壳体连接。本实用新型通过设置驱动打散组件和转动筛粉组件分别进行的花朵打散和花粉颗粒收集，避免杂质堵塞在第一壳体中和第二壳体中。