本实用新型提供一种烟支激光打孔的控制系统，包括：控制器、激光打孔装置和对射式光纤传感器。所述激光打孔装置设置在打孔轮的上方，对设置在所述打孔轮上的烟支进行打孔。所述打孔轮的两端处对称设有支撑板，所述支撑板上设有检测槽。所述对射式光纤传感器发射端设置在一侧的所述支撑板上，并通过所述检测槽与设置在另一侧的所述支撑板上的所述对射式光纤传感器的接收端相对应，以对处于所述激光打孔装置所对应的所述打孔轮上的轮槽进行堵塞检测。所述对射式光纤传感器与所述控制器信号连接，所述控制器根据所述对射式光纤传感器的检测信号控制所述激光打孔装置停止或运行。本实用新型能提高烟支生产效率和质量。