本申请公开了一种根尖手术医疗器械盒，涉及器械收纳盒领域。本申请解决了现有技术医疗器械盒中的器械由于集中存放而导致医护人员拿取不方便以及医疗器械盒在移动或者消毒过程中，器械相互碰撞而发生损坏的问题。该医疗器械盒包括盒盖、盒体和存放台；盒体开设有用于供消毒蒸汽进出的多个第一消毒孔；盒盖用于盖合盒体，并开设有与多个第一消毒孔一一对应的多个第二消毒孔；存放台开设有多种存放孔，至少部分存放孔设置有弹性垫，且弹性垫设置有与所放置器械的端部适配的开孔。医疗器械可以插入存放孔中，使得医护人员可以快速地对所需要的器械进行使用。对一些表面容易刮花的器械，设置弹性垫可以对器械进行保护，防止在放置时受损。