本实用新型公开了一种磁热效应测量仪用冷阱缺水保护水冷系统，包括：冷却水箱、水泵、水流开关、第一排气阀、入口水罐、第二排气阀、出口水罐、冷却器；水流开关的水路入口通过管路连接冷却水箱，水路出口通过管路连接入口水罐的上部，入口水罐的底部通过管路连接冷却器的进水口，冷却器的出水口通过管路连接出口水罐的底部，出口水罐的上部通过管路连接冷却水箱；第一排气阀设置在入口水罐的顶部，第二排气阀设置在出口水罐的顶部，水泵设置在管路上。本实用新型的使用，能够避免停水造成冷阱损坏。