本实用新型公开了一种空调单元及机柜温控系统，空调本体内形成有蒸发侧腔体和冷凝侧腔体，蒸发侧腔体开设有蒸发侧回风口和蒸发侧送风口，冷凝侧腔体开设有冷凝侧回风口和冷凝侧出风口；将蒸发侧腔体和冷凝侧腔体均开设在空调本体内，使空调单元单独具备对机柜温控系统中的机柜单元的制冷能力，由于空调单元一体成型，使得空调单元便于搬运，且无需考虑吸热制冷换热装置与放热换热装置之间的管路连接，并且冷凝侧腔体在竖直方向上的投影落入蒸发侧腔体中，相当于冷凝侧腔体设置在蒸发侧腔体的上方或下方，令空调单元占地面积小，使空调单元能够方便地通过载具移动；因此，空调单元具有较高的可搬运性，提高了空调单元的布置灵活性。