本实用新型公开了一种农业面源污染物高效生态拦截装置，包括方管形的拦截体，所述拦截体内壁固定连接有破碎机箱，所述破碎机箱侧壁通过轴承贯穿转动连接有转动杆，所述转动杆位于破碎机箱外的一端过盈配合有第一锥齿轮，所述转动杆位于破碎机箱与第一锥齿轮间的部分焊接有涡流叶轮，所述拦截体顶壁通过轴承贯穿转动连接有往复丝杠，所述往复丝杠位于拦截体内的一端过盈配合有第二锥齿轮，所述第一锥齿轮与第二锥齿轮啮合，所述往复丝杠螺纹连接有滑块，所述滑块下表面固定连接有活塞，所述拦截体顶壁贯穿固定连接有通气管，所述活塞与通气管内壁密封滑动连接。本实用新型可增加水中的含氧量便于微生物进行降解。