本实用新型涉及控制包埋颗粒短程硝化反硝化的装置，包括：进水模块、恒温加热模块、碱投加模块、游离亚硝酸实时监测模块、曝气风机、好氧池、缺氧池、MBR池、出水模块和排泥模块；进水模块、恒温加热模块和游离亚硝酸实时监测模块均与好氧池相连接；碱投加模块与缺氧池相连接；曝气风机分别连接好氧池和MBR池的底部；MBR池内还设置有出水模块和排泥模块。本实用新型的有益效果是：本实用新型通过好氧池回流，控制好氧池FNA在较高水平，抑制包埋颗粒内NOB活性，使氨氮氧化停留在亚硝化阶段，可实现包埋颗粒短程硝化反硝化稳定性，系统总氮去除率达85％以上，能耗可降低15％左右。