本实用新型涉及一种包埋底座，包括由金属薄板压制而成的主体，所述主体包括外平板和位于所述外平板中间并向下凹陷的容纳槽，所述外平板的下侧设置有定位连接结构。在对生物组织进行包埋时，需要将包埋底座准确放置到滴蜡头的下侧，可在对应的位置设置于定位连接结构相适配的辅助定位结构，因而可通过自动抓取装置，自动将包埋底座放置到辅助定位结构上，使得定位连接结构与辅助定位结构相配合，进而确保包埋底座位于滴蜡头的正下方，从而方便实现自动对生物组织进行包埋。