La présente invention concerne un système (20) de contrôle d'une installation sous pression. Le système (20) comprend au moins deux chaînes de mesure (21, 22) indépendantes, parmi lesquelles une première chaîne de mesure (21) adaptée pour mesurer des paramètres (N1, P1) caractéristiques du fonctionnement d'une première partie de l'installation et une deuxième chaîne de mesure (22) adaptée pour mesurer des paramètres (N2, P2) caractéristiques du fonctionnement d'une deuxième partie de l'installation. Le système (20) comprend également deux automates (31, 32) programmables raccordés chacun à une chaîne de mesure (21, 22), ainsi qu'un terminal de pilotage (60). Les deux automates (31, 32) en communication comparent les paramètres caractéristiques (N1, P1) de la première partie et les paramètres caractéristiques (N2, P2) de la deuxième partie pour détecter un fonctionnement anormal de l'installation ou des chaînes de mesure (21, 22), de manière à transmettre une alerte de sécurité en vue d'une intervention de maintenance et/ou à activer des moyens de protection équipant l'installation. L'invention concerne également un procédé de contrôle d'une installation, ainsi qu'une installation équipée d'un tel système (20).