本发明提供了一种嵌入式文件系统的跨区访问方法，其包括以下步骤：步骤a，在程序代码和EFS共享存储的BANK定义临界资源区；步骤b，判断操作指令的类型，若为读或写操作指令，则利用临界资源区对FLASH进行分时异步操作，若为擦除数据操作指令，则在不影响其它应用程序正常执行的情况下，将擦除数据操作指令放入实时操作系统中进行管理。本发明提供的嵌入式文件系统的跨区访问方法引入了一种新的EFS空间分配机制，通过定义临界资源保护区和任务机进行分时异步操作，无需考虑存储器的BANK边界对EFS空间划分的限制，充分利用了存储器的闲置空间，提高了FLASH空间的利用效率并降低了成本。