L'invention concerne un système microfluidique (1) comprenant : – au moins un canal (2) pour l'écoulement de fluide présentant une entrée (4), une sortie (5), et un axe longitudinal (7) s'étendant entre l'entrée (4) et la sortie (5), ledit canal (2) comprenant une zone de capture (3), et la section du canal (2) orthogonale à l'axe longitudinal (7) du canal (2) étant croissante dans la zone de capture (3), de l'entrée (4) vers la sortie (5) du canal (2); et – des moyens d'application (6) d'un champ magnétique présentant une intensité décroissante dans la zone de capture (3) du canal (2), de l'entrée (4) vers la sortie (5) du canal. L'invention concerne aussi un procédé de traitement d'un échantillon pouvant être mis en œuvre avec ce système.