【課題】分包袋や薬剤の破損等を抑制しつつ、鑑査結果を適切に出力可能な薬剤鑑査システムの提供を目的とした。 【解決手段】薬剤鑑査システム１０は、鑑査対象の分包袋ｐを撮影した画像に基づき、分包袋ｐ内に収容されている薬剤の数量及び種類のいずれか一方又は双方を鑑査する鑑査装置２０と、鑑査装置２０による鑑査結果を分包袋ｐに記すマーキング装置５０とを有する。分包紙の重複部分を圧着させて形成されたシール部Ｓを有する分包袋ｐを鑑査装置２０において鑑査した後、その鑑査結果を示す印がマーキング装置５０によってシール部Ｓに出力される。