提供一种燃料电池低温快速启动系统及其启动方法，包括空气压缩机（1）和燃料电池组（2），空气压缩机（1）通过一输气管（4）与燃料电池组（2）相连，空气压缩机（1）的进气口连接有一进气管（3），进气管（3）上设有入口空气阀（6），燃料电池组（2）的出气口连接有一排气管（5），排气管（5）上设有限压阀（7），燃料电池组（2）的出气口还设有一支路管道（8）与空气压缩机（1）的进气口相连，使空气压缩机（1）、输气管（4）、燃料电池组（2）及支路管道（8）构成一循环回路，并且支路管道（8）上设有回路空气阀（9），上述空气压缩机（1）、入口空气阀（6）、限压阀（7）、温度传感器及回路空气阀（9）均与一控制器连接。通过设置一支路管道使空气压缩机和燃料电池组接通循环回路，以达到使燃料电池在低温条件下迅速冷启动的目的。