본 발명은, 광선치료기를, 스마트통신기기 및 정보제공서버와 연동시켜 광선 치료를 행하도록 이루어지되, 사용자가 스마트통신기기에서 소정 질병에 따른 광 제조 임상코드를 구매하면, 정보제공서버는, 광선의 파장, 광선의 세기, 광선의 조사시간, 광선의 조사패턴을 포함하는 소정 질병의 광 제조 임상코드를 생성하여 스마트통신기기로 전송하며, 스마트통신기기는, 수신된 광 제조 임상코드를 광선치료기로 전송하거나, 광 제조 임상코드에 따라 광선치료기 제어신호를 생성하여 광선치료기로 전송하여, 광선치료기를 구동하게 하여, 다양한 질병이나 증상에 따라 맞춤형 치료를 할 수 있는, 스마트통신기기 기반의 광선치료 서비스 제공 시스템 및 방법에 관한 것이다. 본 발명의 스마트통신기기 기반의 광선치료 서비스 제공 시스템은, 광선의 파장, 광선의 세기, 광선의 조사시간, 광선의 조사패턴을 포함하는 광 제조 임상코드를 구매하기 위한, 구매하기 화면이 출력되고, 금융결제서버와 연동되어 광 제조 임상코드의 구매에 대한 결제가 완료되면, 정보제공서버로부터, 광 제조 임상코드를 수신하여 광선치료기로 전송하거나, 광 제조 임상코드에 따라 광선치료기 제어신호를 생성하여 광선치료기로 전송하는, 스마트통신기기; 스마트통신기기가 금융결제서버와 연동되어 광 제조 임상코드의 결제가 완료되면, 광 제조 임상코드를 정보제공서버 DB로부터 읽어들여 스마트통신기기로 전송하는, 정보제공서버; 스마트통신기기로부터 수신된 광 제조 임상코드 또는 광선치료기 제어신호에 따라 구동되는, 광선치료기;를 포함하여 이루어진 것을 특징한다.