ドクターが蛍光薬剤の発光が定常状態になったか否かの判断を行う際に、その判断を支援することができる内視鏡システム、画像処理装置、画像処理方法およびプログラムを提供する。内視鏡システム１は、第１算出部６６１が順次算出した変化量が蛍光の発現を示す第１閾値以上であるか否かを判定する第１判定部６６２と、第１判定部６６２によって変化量が第１閾値以上であると判定された後に、第１算出部６６１が順次算出した変化量が蛍光の定常状態を示す第２閾値未満であるか否かを判定する第２判定部６６３と、第２判定部６６３によって変化量が第２閾値未満であると判定された場合、蛍光薬剤の蛍光が定常状態になった旨を出力する出力部と、を備える。