公开(公告)号：CN108387561A

公开(公告)日：2018-08-10

申请号：CN201810046831.0

申请日：2018-01-18

Applicant: 大连理工大学

Inventor： 杨成 ,  宋彩侨 ,  孙迎迎

IPC: G01N21/64

CPC classification number: G01N21/6428 ,  G01N2021/6432

Abstract: 一种基于碱基淬灭荧光原理实现低成本高通量核酸适配体最优序列的优化方法属于分子生物学领域，包括：将已获得长链核酸适配体分成若干个含有G碱基的段；对含有G碱基的段分别设计互补序列，使互补序列的3’端的对位有突出的G碱基；设计合适的互补短链的长度；将核酸适配体与靶标分子在结合溶液中反应后，加入荧光素标记的互补短链，根据荧光强度判断各个区域对结合的影响，判断结合区域；以与中心结合区域互补的探针为指示，通过截短、分割等手段获得能与靶标分子结合的最短核酸序列。本发明优化方法更快速，所需标记的荧光序列少，标记荧光探针具有通用性，可同时对多条核酸序列进行优化及新设计的核酸适配体序列进行结合能力进行表征。

公开(公告)号：CN108387561B

公开(公告)日：2019-08-09

申请号：CN201810046831.0

申请日：2018-01-18

Applicant: 大连理工大学

Inventor： 杨成 ,  宋彩侨 ,  孙迎迎

IPC: G01N21/64

Abstract: 一种基于碱基淬灭荧光原理实现低成本高通量核酸适配体最优序列的优化方法属于分子生物学领域，包括：将已获得长链核酸适配体分成若干个含有G碱基的段；对含有G碱基的段分别设计互补序列，使互补序列的3’端的对位有突出的G碱基；设计合适的互补短链的长度；将核酸适配体与靶标分子在结合溶液中反应后，加入荧光素标记的互补短链，根据荧光强度判断各个区域对结合的影响，判断结合区域；以与中心结合区域互补的探针为指示，通过截短、分割等手段获得能与靶标分子结合的最短核酸序列。本发明优化方法更快速，所需标记的荧光序列少，标记荧光探针具有通用性，可同时对多条核酸序列进行优化及新设计的核酸适配体序列进行结合能力进行表征。