公开(公告)号：CN113223621A

公开(公告)日：2021-08-06

申请号：CN202110532117.4

申请日：2021-05-17

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 吕晖 ,  张悦宁 ,  任永永 ,  程志伟 ,  李磊杰 ,  顾坚磊 ,  王晓雷

IPC: G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明涉及一种用于生物医学的全链条数据分析系统，包括与个人中心模块分别连接的用户管理系统、仓储管理系统和在线分析系统，仓储管理系统包括代码仓储模块、软件仓储模块和数据仓储模块，在线分析系统设有工作流应用发布子系统，调用代码仓储模块和软件仓储模块中的代码和软件，对数据仓储模块中储存的数据或接收到的在线上传的数据进行分析，并输出分析结果。与现有技术相比，本发明具有分析环节的纵向覆盖度广、分析对象的横向覆盖度广、开发复杂度低、良好的可扩展性以及可在线运行等优点。

公开(公告)号：CN113158113A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110539383.X

申请日：2021-05-17

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 吕晖 ,  任永永 ,  程志伟 ,  李磊杰 ,  张悦宁

IPC: G06F16/957 ,  G06F16/906 ,  G06Q10/06 ,  G06Q10/10

Abstract: 本发明涉及一种生物信息分析工作流多用户云端访问方法、管理系统，方法包括以下步骤：开发用户根据本地的生物信息分析工作流所需计算参数，建立生物信息分析工作流的参数配置控件，并将二者上传至云端工作流库；云端访问用户自云端工作流库选择生物信息分析工作流，基于参数配置控件输入所需计算参数的取值，输入生物医学数据；Web服务器将生物医学数据和所需计算参数的取值传递给计算服务器，计算服务器为生物信息分析工作流分配计算资源，得到分析结果并回传给Web服务器。与现有技术相比，用户无需自行配置Web服务器、编写网络界面，能够高效率的将单用户使用的本地生物信息分析工作流转化为多用户使用的云端生物信息分析工作流，操作简单。

公开(公告)号：CN113157291A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110559098.4

申请日：2021-05-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 吕晖 ,  李磊杰 ,  任永永 ,  程志伟 ,  张悦宁 ,  戴芳

IPC: G06F8/61 ,  G06F8/65 ,  G06F8/71 ,  G06F9/455

Abstract: 本发明涉及一种基于云存储的生物分析软件管理方法及系统，其中方法包括：步骤S1：显示平台存储的软件信息，其中，软件信息包括软件ID、软件名称和版本号；步骤S2：判断是否收到确认信号，若为是，则执行步骤S4，反之，则执行步骤S3；步骤S3：接收上传的软件，分配软件ID并创建软件信息，返回步骤S2；步骤S4：根据输入信号基于平台存储的软件搭建工作流程；步骤S5：接收工作流程执行信号，并判断是否需要在线运行，若为是，则在线运行并返回运行结果，反之，则提供工作流程所调用的软件的下载。与现有技术相比，本发明具有提高工作流程运行的便捷性和可靠性等优点。