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公开(公告)号：CN105567816A
公开(公告)日：2016-05-11
申请号：CN201610003007.8
申请日：2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪8号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr8:109488182；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr8-PCRU：5’-TTG GCT GTC TGT CCA CCA-3’；Chr8-PCRL：5’-AAT TTC TGA CCT GGG TTC ATG-3’；Chr8-SNPU：5’-GAC TGA CTG ACT GAC TGA CTG AAT ATA TCC GGT TTG CTT CCT TAC-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C基因型，带有T/T基因型的母猪产仔数最高。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr8:109488182这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN105543357A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201610003244.4
申请日：2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪4号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:113326205；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr4-2-PCRU：5’-AAA GCA TTA ATG ATA CAG CCT GC-3’；Chr4-2-PCRL：5’-TTG TGA ACT GGG TAA ATG GAA-3’；Chr4-2-SNPU：5’-ACT GAC TGA CTG ACT TTG AGT ACT GCT GTA GCT TCC AAT A-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型，C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr4:37340666这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN105483259A
公开(公告)日：2016-04-13
申请号：CN201610002991.6
申请日：2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪12号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr12:11177285；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr12-PCRU：5’-CAA TGC AGA GAT CCA ACT CC-3’；Chr12-PCRL：5’-AAA ATC CAG GCG CAG ATC-3’；Chr12-SNPU：5’-CTG ACT GAC TGT TCT TTA TCC TGC CCC ATT AAT TA-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C基因型，带有T/T基因型的母猪产仔数最高，带有T/C基因型的母猪产仔数最低。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr12:11177285这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN103757010B
公开(公告)日：2016-01-20
申请号：CN201310729499.5
申请日：2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记，具体涉及猪8号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物，属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa10.2的Chr8:112522819；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，该位点及其侧翼序列如SEQ ID NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为：Chr8-PCRU：5’-ACT TCA TCA CAA GGG TTT TTT TT-3’；Chr8-PCRL：5’-ATA TTT TAT GGC AAG AGG TTT ATT TG-3’；Chr8-SNPU：5’-AGT ATA ATC ACA GAT GAC TAT TTT C-3’。带有C/C基因型的猪产仔数高于T/C和T/T基因型。本发明的有益效果在于：运用全基因组重测序方法，能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因，Chr8:112522819这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN103789412B
公开(公告)日：2015-04-29
申请号：CN201310723429.9
申请日：2013-12-25
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所
Abstract: 本发明提供一种中国家猪品种种质资源分子鉴定位点及其位点扩增引物，属于生物技术领域。本发明的12个鉴定位点的坐标为：chr4_90338649、chr6_46031147、chr3_40173091、chr1_304503930、chr8_55949794、chr4_51135766、chr14_51320355、chr14_71621254、chr6_261199、chr1_82559795、chr15_101338073、chr4_81507260，12个鉴定位点中国家猪的优势等位基因分别是G、T、A、T、A、C、A、C、C、A、T、G。用于中国家猪品种种质资源分子鉴定位点扩增的引物如表1所示。本发明的有益效果在于：筛选中国家猪遗传组分中特有的单核苷酸标记位点，通过现代分子生物学技术检测分子标记位点的基因型，用于有效地鉴定并区分中国家猪品种与中国野猪血缘。为中国家猪的育种及种质资源保护过程中种质的鉴定提供准确指导。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103789412A
公开(公告)日：2014-05-14
申请号：CN201310723429.9
申请日：2013-12-25
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明提供一种中国家猪品种种质资源分子鉴定位点及其位点扩增引物，属于生物技术领域。本发明的12个鉴定位点的坐标为：chr4_90338649、chr6_46031147、chr3_40173091、chr1_304503930、chr8_55949794、chr4_51135766、chr14_51320355、chr14_71621254、chr6_261199、chr1_82559795、chr15_101338073、chr4_81507260，12个鉴定位点中国家猪的优势等位基因分别是G、T、A、T、A、C、A、C、C、A、T、G。用于中国家猪品种种质资源分子鉴定位点扩增的引物如表1所示。本发明的有益效果在于：筛选中国家猪遗传组分中特有的单核苷酸标记位点，通过现代分子生物学技术检测分子标记位点的基因型，用于有效地鉴定并区分中国家猪品种与中国野猪血缘。为中国家猪的育种及种质资源保护过程中种质的鉴定提供准确指导。
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公开(公告)号：CN103757010A
公开(公告)日：2014-04-30
申请号：CN201310729499.5
申请日：2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的分子标记，具体涉及猪8号染色体上一个与产仔数相关的分子标记及其引物，属生物技术领域。该分子标记位点为基因组版本NCBI？Build？Sscrofa10.2的Chr8:112522819；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，该位点及其侧翼序列如SEQ？ID？NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为：Chr8-PCRU：5’-ACT？TCA？TCA？CAA？GGG？TTT？TTT？TT-3’；Chr8-PCRL：5’-ATA？TTT？TAT？GGC？AAG？AGG？TTT？ATT？TG-3’；Chr8-SNPU：5’-AGT？ATA？ATC？ACA？GAT？GAC？TAT？TTT？C-3’。带有C/C基因型的猪产仔数高于T/C和T/T基因型。本发明的有益效果在于：运用全基因组重测序方法，能够快速、批量地筛选与性状相关的分子标记或候选基因，Chr8:112522819这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN103757007A
公开(公告)日：2014-04-30
申请号：CN201310727948.2
申请日：2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪5号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该位点为基因组版本NCBI？Build？Sscrofa？10.2的Chr5:32282098；该位点的等位基因为T和C，该位点及其侧翼序列如SEQ？ID？NO:1所示。扩增权利要求1所述SNP位点的引物及延伸引物为：Chr5-2-PCRU：5’-TTT？TTC？TGG？TCA？TGG？TAG？TTT？TG-3’；Chr5-2-PCRL：5’-ATA？CTG？AGG？ACC？TAC？ACA？CAA？AAC？A-3’；Chr5-2-SNPU：5’-TGA？CTA？GCT？TTA？GCT？TGT？TTT？GAG？TGT？TAG-3’。该位点有C/C、T/C和T/T三种基因型，带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型个体。本发明的有益效果在于：运用全基因组重测序方法，能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或候选基因，Chr5:32282098这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN103757003A
公开(公告)日：2014-04-30
申请号：CN201310727898.8
申请日：2013-12-26
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪13号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI？Build？Sscrofa10.2的Chr13:11714625；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，该位点及其侧翼序列如SEQ？ID？NO:1所示。扩增该分子标记位点的引物及延伸引物为：Chr13-2-PCRU：5’-ATA？ACC？CTG？TTA？CAT？TAC？CCT？ATA？TTC？C-3’；Chr13-2-PCRL：5’-AAA？AGT？AAA？ATA？TGA？CTG？TTT？GGA？AGG-3’；Chr13-2-SNPU：5’-TGA？CTG？ACT？GAC？TGA？CTG？ACT？GAC？TGC？ATA？GTA？GAC？CAG？CTC？CCC？TAT？TT-3’。带有T/T基因型的猪产仔数高于T/C和C/C基因型。本发明的有益效果在于：运用全基因组重测序方法，能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或候选基因，Chr13:11714625这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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公开(公告)号：CN105543358B
公开(公告)日：2019-05-31
申请号：CN201610003328.8
申请日：2016-01-04
Applicant: 中国科学院昆明动物研究所 , 江西农业大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪3号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59516174；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr3‑2‑PCRU：5’‑TAG TGG CCT CTT CCT GTC AC‑3’；Chr3‑2‑PCRL：5’‑CAA AAT AAG GAG CTG GTT CCT‑3’；Chr3‑2‑SNPU：5’‑AGG GGC AGC ACA GGC CCC CAT TCA G‑3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于C/C基因型,T为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr3:59516174这个位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。
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