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    一种基于蒙特卡罗模拟的抗菌药物药效计算方法
    21.
    发明公开
    一种基于蒙特卡罗模拟的抗菌药物药效计算方法 无效

    公开(公告)号：CN106407676A

    公开(公告)日：2017-02-15

    申请号：CN201610816050.6

    申请日：2016-09-12

    申请人： 广东省农业科学院动物科学研究所 ,  广州五丰动物保健品有限公司

    发明人： 刘志昌 ,  容庭 ,  王刚 ,  李书宏 ,  宋浩铭 ,  彭广辉 ,  钟勇锋

    IPC分类号： G06F19/00

    CPC分类号： G06F19/706 ,  G06F19/704

    摘要： 本发明公开了一种基于蒙特卡罗模拟的抗菌药物药效计算方法，其特征在于，包括如下步骤：1）确定抗菌药物属于浓度依赖型还是时间依赖型，选择PK/PD参数及其目标值；2）若药物属于浓度依赖型药物，PK/PD参数为AUC/MIC，AUC=Dose/CL，AUC/MIC=Dose/CL/MIC；3）若药物属于时间依赖型药物，PK/PD参数为%T>MIC，对于不同模型，先采用二分法求出f(c,θ,t)-MIC=0的解t1和t2，再通过公式(t2-t1)/24求出%T>MIC的值；4）对参数初始化，设置蒙特卡罗模拟运行次数N；5）对动学参数和细菌MIC的分布进行假设；6）运行模拟并记录结果；7）重复模拟，直到循环终止；8)计算达标率TAR，以及对结果作图表。本发明能同时预测浓度依赖型和时间依赖型抗菌药物药效，以便能提供合理的给药方案。

    三维结构活性相关法
    26.
    发明公开
    三维结构活性相关法 失效

    公开(公告)号：CN1703704A

    公开(公告)日：2005-11-30

    申请号：CN200380100987.4

    申请日：2003-10-07

    申请人： 日本臓器制药株式会社

    发明人： 小谷孝行 ,  东浦邦彦

    IPC分类号： G06F17/50

    CPC分类号： G06F19/704 ,  G06F19/706 ,  G06F19/707

    摘要： 三维结构活性相关法的组解析包含以下的工序：寻求在虚拟空间内已叠合的多个分子所包含的各原子坐标的工序B1；计算各原子与其它原子的原子间距离，对所计算的原子间距离中的最短的原子间距离及构成该最短的原子间距离的2个原子进行特定的工序B2；所计算的最短原子间距离在规定的阈值以下时，将具有最短原子间距离的2个原子从三维空间删除的同时，在该删除的2个原子的坐标的加权平均坐标上制作代表这2个原子的原子的工序B3；在工序B3之后，返回到工序B2的工序B4；所计算的最短原子间距离超过规定的阈值时，结束工序B的第5工序B5。该方法能够大幅度减少3D QSAR解析所需的计算量和存储空间。

    一种中药组方设计及疗效评价数学模型构建方法
    27.
    发明公开
    一种中药组方设计及疗效评价数学模型构建方法 无效

    公开(公告)号：CN107729714A

    公开(公告)日：2018-02-23

    申请号：CN201711011708.7

    申请日：2017-10-26

    申请人： 河南省中医药研究院附属医院

    发明人： 范军铭 ,  范航

    IPC分类号： G06F19/00 ,  G16H50/20

    CPC分类号： G06F19/706

    摘要： 本发明涉及中医药数学建模技术领域，具体涉及一种中药组方设计及疗效评价数学模型构建方法，将中医理论的内容作为论域，利用模糊数学的方式，构建病症和中药的位置信息模糊集、病性信息模糊集和状态信息模糊集，在构建计算出证素矩阵和病位病性运行状态矩阵，再经过排列组合后得出对应的证候指数，利用该指数将病症和中药进行定量，再利用定量的处方指数来判断病症对应的药方，评价药方对病症的治疗效果，实现中医治疗的定量化，能够有效的促进中医的推广和应用。

    α<base:Sub>1</base:Sub>‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法
    28.
    发明公开
    α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法 有权

    公开(公告)号：CN106960118A

    公开(公告)日：2017-07-18

    申请号：CN201710105754.7

    申请日：2017-02-23

    申请人： 邹长林

    发明人： 邹长林 ,  许芳 ,  孙宪强 ,  章慧 ,  陈文豪 ,  陈星星 ,  李慧芳

    IPC分类号： G06F19/00

    CPC分类号： G06F19/705 ,  G06F19/706

    摘要： 本发明涉及一种α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法，建立方法包括步骤：以α1‑AR亚型蛋白的氨基酸序列为探针，搜索蛋白晶体数据库，通过氨基酸序列比对得到相似度最高的同源模板β2‑AR；使用的Prime模块对α1‑AR亚型蛋白同源模建；采用Macromodel模块对同源模建得到的蛋白优化，通过模型评价得到α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型。本发明提供了α1‑AR三个亚型蛋白α1A‑AR、α1B‑AR和α1D‑AR的模型构象，为准确研究靶点和拮抗剂的构效关系提供了基础；并模建了可能的结合口袋，找到关键残基，为解释α1‑AR亚型选择性拮抗剂的选择度提供理论依据。

    评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法
    29.
    发明公开
    评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法 有权

    公开(公告)号：CN106709231A

    公开(公告)日：2017-05-24

    申请号：CN201610912539.3

    申请日：2016-10-19

    申请人： 王忠 ,  王朋倩

    发明人： 王忠 ,  王朋倩

    IPC分类号： G06F19/00

    CPC分类号： G06F19/706

    摘要： 本发明提供一种针对生物分子的复杂网络，如蛋白质相互作用网络、基因表达调控网络、生物代谢网络、表观遗传网络、表型网络、信号转导网络，评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法。主要步骤如下：针对药物干预前后的生物分子网络分别进行模块的识别；基于识别的两组模块，对模块间直接和间接联系参数进行计算、筛选、整合，获得每组模块中任意两个模块的模块间协调系数；基于模块间协调系数，构建模块网络；对比药物干预前后的模块网络拓扑参数，或识别药物干预前后的模块网络连接子，计算连接子离解率。