一种草鱼肠系膜脂肪组织高质量总RNA的提取方法

    公开(公告)号:CN111518796B

    公开(公告)日:2022-03-04

    申请号:CN202010359633.7

    申请日:2020-04-30

    IPC分类号: C12N15/10

    摘要: 本发明公开了一种草鱼肠系膜脂肪组织高质量总RNA的提取方法,包括样品液氮速冻,TRIzol试剂裂解与机械匀浆,离心去除油脂层,氯仿分离含RNA水相,异丙醇沉淀和75%乙醇洗涤等步骤。在样品前处理阶段,本发明通过增加取样量至30mg,可提升产量以满足常规分子生物学实验对RNA量的需求;样品采用液氮速冻,无需人工研磨,并将冻样在TRIzol试剂中进行长时间机械匀浆,时长3min,可显著降低RNA降解发生,同时增加2次离心去除油脂层等操作步骤,获得的总RNA纯度和完整性较高。本发明的提取方法有效解决了草鱼脂肪组织RNA提取易降解,产量低等问题,且操作简单,批处理效果稳定,可满足转录组测序等高质量RNA要求的实验,也适用于其它鱼类脂肪组织总RNA的提取。

    快长优质草鱼SNPs及其应用
    34.
    发明公开

    公开(公告)号:CN111454958A

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN202010228130.6

    申请日:2020-03-27

    摘要: 本发明公开了快长优质草鱼SNPs及其应用,本发明通过检测草鱼的三个SNP标记,SNP1位于草鱼基因SEQ ID NO.1第175位碱基、SNP2位于草鱼基因SEQ ID NO.1第4139位碱基、SNP3位于草鱼基因SEQ ID NO.1第4516位碱基。通过SNP位点的筛选,能够在相同养殖条件下快速获得体重、体长、体高和体宽优异,肥满度低的生长快且体型修长的草鱼个体。本发明保证了检测结果的可靠性,无需繁琐操作进行测序分析,提高了处理效率和精确性。本发明能够有效用于草鱼的分子标记辅助育种,加快草鱼育种进程。

    草鱼生长速度相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106381331B

    公开(公告)日:2019-09-03

    申请号:CN201610783957.7

    申请日:2016-08-31

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明通过对NPY基因部分片段进行扩增,通过SNaPshot SNP分型方法,提供一种草鱼生长速度相关的SNP标记,其中,S1位于NPY基因的内含子1序列中自起始密码子(ATG,以ATG的第一个核苷酸为第一位)起第639位,且该位置处碱基为T或A;S2位于NPY基因的内含子1序列中自起始密码子起第892位,且该位置处碱基为C或A。这两个SNP位点可用于鉴定或选育生长速度较快的草鱼,为筛选和建立草鱼快长新品系奠定基础。

    一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN107022647A

    公开(公告)日:2017-08-08

    申请号:CN201710479605.7

    申请日:2017-06-22

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种SNP标记,尤其涉及一种与大口黑鲈生长性状相关的SNP标记及其应用,所述SNP标记为SEQ ID NO.2序列284bp处的碱基多态位点。本发明创造性地提供了一种与大口黑鲈的生长性状相关的SNP标记,SNP标记不同的基因型与大口黑鲈的生长性状的相关性已经得到证实,在此基础上,利用该SNP标记,可以进行大口黑鲈的筛选或检测,或大口黑鲈的人工养殖过程中易于驯食人工配合饲料的大口黑鲈或其亲本的筛选或检测,在大口黑鲈的养殖或选育领域,都具有积极的效果,及在此基础上,开发了一系列的引物对、方法及相应试剂盒,具有很大的科学价值和商业价值。

    与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN106701931A

    公开(公告)日:2017-05-24

    申请号:CN201611155670.6

    申请日:2016-12-14

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示;所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A,CC个体的生长速度显著高于AA个体;所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体;所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用,可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性,可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。

    鉴定大口黑鲈遗传性别的分子标记及应用

    公开(公告)号:CN113637765B

    公开(公告)日:2023-07-21

    申请号:CN202110804834.8

    申请日:2021-07-16

    摘要: 本发明公开了鉴定大口黑鲈遗传性别的分子标记及应用,分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明从大口黑鲈中筛选获得了性别差异的DNA片段,将基因组序列为SEQ ID NO:1的SNP分子标记用于大口黑鲈遗传性别鉴定,并根据差异的片段设计检测引物,从而可以快速、准确的区分大口黑鲈的性别。利用本发明的SNP位点,在生产上可快速对大口黑鲈遗传进行鉴定,在大口黑鲈单性育种方面具有重要的应用价值,同时在定位性别决定基因及性别决定机制研究中也具有重要应用前景。与之前解剖检测或生殖孔观察相比,该技术具有目的性强、准确度高的优点,且操作简单、检测快速,对鱼体伤害少,易于推广。

    一种定量检测鱼类肠系膜脂肪沉积量的方法以及应用

    公开(公告)号:CN113899709A

    公开(公告)日:2022-01-07

    申请号:CN202111059890.X

    申请日:2021-09-10

    IPC分类号: G01N21/31 G01N1/30

    摘要: 本发明提供一种定量检测鱼类肠系膜脂肪沉积量的方法以及应用。本发明基于脂溶性染料油红O可特异性着色脂肪组织的特性,开发出一种精确、便捷定量鱼类肠系膜脂肪沉积量的方法。采用染色‑萃取技术方案,避免传统解剖刀刮取脂肪组织直接称量方法的量化粗糙、误差大、操作不便利等问题,通过内脏团样品采集处理、样品标记、固定、脱水、定染、漂洗、萃取和定量等操作步骤,获得个体肠系膜脂肪的沉积量,是以样品吸附并萃取出的油红O质量来表示,可用于精准比较鱼个体间肠系膜脂肪沉积的差异。