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公开(公告)号:CN117604115A
公开(公告)日:2024-02-27
申请号:CN202311218054.0
申请日:2023-09-20
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及一种地方鸡40K全基因组SNP液相芯片及其应用。本发明通过全基因组重测序技术获得中国地方鸡58个品种的955个个体的全基因组遗传信息,通过严格筛选获得45669个SNP分子标记,其中40595个源于鸡参考基因组,其余5074个源于鸡泛序列。以获得的SNP分子标记为检测靶点的地方鸡40K全基因组液相芯片,可以通过靶向捕获高通量测序技术进行基因分型,经检测分型检出率达99.6%,且一致性良好。随机品种SNP分型验证说明,本发明的液相芯片分型与基因组重测序相比,主成分分析结果一致性极高。本发明的液相芯片为中国地方鸡遗传资源鉴定、遗传资源保护提供了重要的技术支撑。
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公开(公告)号:CN114150071B
公开(公告)日:2023-07-25
申请号:CN202010937177.X
申请日:2020-09-08
Applicant: 河南农业大学
Inventor: 康相涛 , 张彦华 , 李转见 , 韩瑞丽 , 李东华 , 孙桂荣 , 田亚东 , 闫峰宾 , 蒋瑞瑞 , 李红 , 李国喜 , 刘小军 , 王彦彬 , 李文婷 , 黄河天 , 宋素芳
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/683 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及鸡TRIM13基因SNP分子标记在鸡生长及屠宰性状改良育种中的应用及育种方法,属于生物育种技术领域。本发明通过研究发现鸡TRIM13基因第3内含子区第87位碱基的1处SNP位点(T‑C,rs732405671)与鸡生长性状及屠宰性状显著相关。该SNP位点的等位基因T与低体重性状正相关,等位基因C与高体重性状正相关,杂合等位基因CT的表型性状处于中间值。对该SNP分子标记基因型进行检测,能够早期、有效的预测鸡成熟期体重,可作为鸡品种遗传改良的分子标记,从而缩短育种时间,加快育种进程。本发明提供了基于鸡TRIM13基因SNP分子标记的鸡生长及屠宰性状改良育种方法,能够用于选育高体重或大体型鸡品种。
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公开(公告)号:CN114875037B
公开(公告)日:2023-06-06
申请号:CN202210612622.4
申请日:2022-05-31
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12N15/12 , C12N15/864 , C12N7/01 , A01K67/027 , C12R1/93
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种鸡GBP4L基因、表达载体及应用。鸡GBP4L基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明首次证明GBP4L基因与鸡热应激相关,通过调控GBP4L基因体内高表达能够有效缓解鸡热应激所导致的炎性因子增加、免疫器官损伤等表型。本发明的研究成果在缓解鸡热应激、耐热应激鸡品种选育方面具有良好的应用前景。
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公开(公告)号:CN110578006B
公开(公告)日:2022-08-26
申请号:CN201810582172.2
申请日:2018-06-07
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鸡浅芦花羽基因的检测方法及应用,属于动物遗传育种技术领域。利用SPEF2基因上游区域4.558kb‑4.450kb之间有107bp碱基序列缺失来判断鸡的浅芦花羽基因型,本发明建立了针对该缺失的PCR基因分型方法,对鸡浅芦花羽基因进行分型,同时还提供了用于检测鸡浅芦花羽基因型的引物P,上游引物P‑F:5′‑GGAAGCAGAGACAAGACTT‑3′;下游引物P‑R:5′‑ATGTATGTAACAAGCGATGC‑3′。该发明所提供的方法操作简单、检测快速、结果准确,有利于在育种实践中更有效、快速地对浅芦花羽性状进行选择,加快育种进展,节约育种成本,为浅芦花羽鸡性状的选育提供快捷的分子选育方法。
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公开(公告)号:CN111500742B
公开(公告)日:2022-04-22
申请号:CN201910101123.7
申请日:2019-01-31
Applicant: 河南农业大学
Inventor: 李转见 , 经珍珠 , 李文雅 , 康相涛 , 田亚东 , 韩瑞丽 , 孙桂荣 , 王鑫磊 , 王永才 , 闫峰宾 , 蒋瑞瑞 , 李红 , 李国喜 , 刘小军 , 李文婷 , 陈悦
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鸡生长性状基因诊断试剂盒及其应用,属于生物育种技术领域。本发明中通过研究发现鸡LncFAM基因第二内含子区97bp的indel多态性标记与鸡生长发育相关。对于该97bp的纯合插入型II、纯合缺失型DD或杂合型ID来说,II基因型个体生长状况最好,ID基因型个体次之,DD基因型个体最次。根据该indel多态性标记设计相应的鸡生长性状基因诊断引物和试剂盒,可以检测出97bp的纯合插入的鸡个体,进而快速的筛选生长速度快的个体进行分子育种,从而缩短育种时间,加快育种进程。
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公开(公告)号:CN108707676B
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN201810570979.4
申请日:2018-06-05
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与鸡致死相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒,属于生物育种技术领域。本发明首次发现了与鸡致死相关的SNP标记,其序列如SEQ ID NO.1所示,其中第267位碱基发生T>G突变,GG的纯合突变会使鸡早期胚胎致死,在鸡群体中该位点仅存在TT基因型或者TG基因型。本发明根据该SNP标记设计特定引物,用以扩增包含该位点在内的目的片段,能够检测出鸡个体的致死突变基因型,淘汰TG基因型的杂合鸡个体,可快速纯合非致死的等位基因,能够提高鸡群的繁殖性能。
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公开(公告)号:CN110734981B
公开(公告)日:2021-08-20
申请号:CN201810802536.3
申请日:2018-07-20
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于绿壳蛋壳色评价的检测SLCO1B3基因启动子区DNA甲基化水平的引物及应用,属于生物技术领域。本发明的引物和试剂盒可对SLCO1B3基因启动子核心区域甲基化水平进行检测,覆盖了该基因启动子核心区域的所有CpG位点,包括对区域甲基化进行统计和所在区域的单个位点进行统计分析,提高了甲基化检测的准确性。本发明的引物和试剂盒还可以对不同周龄的鸡蛋壳腺样本进行SLCO1B3基因启动子核心区域所有CpG位点的甲基化水平进行检测,为SLCO1B3基因启动子甲基化检测提供了一个分子检测方法,可用于鸡蛋壳颜色变化的评价。
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公开(公告)号:CN110578005B
公开(公告)日:2021-07-30
申请号:CN201810581421.6
申请日:2018-06-07
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q1/683 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物及试剂盒、鉴定方法及应用,属于动物遗传育种技术领域。本发明中鸡伴性浅芦花羽的分子标记为CDKN2A基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,第27bp处发生C到T的突变。依据该分子标记设计引物、试剂盒及检测方法,利用本发明提供的检测方法或试剂盒能够检测待测鸡是否携带浅芦花羽性状突变等位基因,从而确定待测鸡是否为浅芦花羽鸡。本发明通过改变引物3’端的碱基来引入限制性内切酶Asu I识别位点,降低了检测成本,提高了检测效率。在实际生产和育种中,可以利用该方法准确剔除或纯合浅芦花羽性状。
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公开(公告)号:CN110578005A
公开(公告)日:2019-12-17
申请号:CN201810581421.6
申请日:2018-06-07
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12Q1/683 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物及试剂盒、鉴定方法及应用,属于动物遗传育种技术领域。本发明中鸡伴性浅芦花羽的分子标记为CDKN2A基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,第27bp处发生C到T的突变。依据该分子标记设计引物、试剂盒及检测方法,利用本发明提供的检测方法或试剂盒能够检测待测鸡是否携带浅芦花羽性状突变等位基因,从而确定待测鸡是否为浅芦花羽鸡。本发明通过改变引物3’端的碱基来引入限制性内切酶Asu I识别位点,降低了检测成本,提高了检测效率。在实际生产和育种中,可以利用该方法准确剔除或纯合浅芦花羽性状。
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公开(公告)号:CN108707676A
公开(公告)日:2018-10-26
申请号:CN201810570979.4
申请日:2018-06-05
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及一种与鸡致死相关的SNP标记及其应用、检测引物、检测试剂盒,属于生物育种技术领域。本发明首次发现了与鸡致死相关的SNP标记,其序列如SEQ ID NO.1所示,其中第267位碱基发生T>G突变,GG的纯合突变会使鸡早期胚胎致死,在鸡群体中该位点仅存在TT基因型或者TG基因型。本发明根据该SNP标记设计特定引物,用以扩增包含该位点在内的目的片段,能够检测出鸡个体的致死突变基因型,淘汰TG基因型的杂合鸡个体,可快速纯合非致死的等位基因,能够提高鸡群的繁殖性能。
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