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公开(公告)号:CN108220402B
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201711422561.0
申请日:2017-12-25
Applicant: 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所
IPC: C12Q1/6858 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种大白菜种质和品种系谱关系的鉴定方法。本发明将带型简单的共显性标记的检测结果转化成A、G、T、C四个字母,并有效的将常规核酸多样性分析软件如DNAMAN、clusterW、MEGA等的序列分析与二倍体大白菜共显性标记赋值分析相结合,解决了NTSYS只能认识二元型的0、1数据矩阵,而不能判读基因型数据或者NTSYS、Popgene等都需要将标记检测结果按软件的要求转化为0/1矩阵或者AA/BB字母矩阵的繁琐性问题。本发明方法与NTSYS聚类结果比较基本一致,但省去了NTSYS聚类分析软件的标记文件准备步骤,操作简单,并且该方法适合分析杂交种和纯系之间的关系。
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公开(公告)号:CN108220402A
公开(公告)日:2018-06-29
申请号:CN201711422561.0
申请日:2017-12-25
Applicant: 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所
IPC: C12Q1/6858 , G06F19/24
Abstract: 本发明公开了一种大白菜种质和品种系谱关系的鉴定方法。本发明将带型简单的共显性标记的检测结果转化成A、G、T、C四个字母,并有效的将常规核酸多样性分析软件如DNAMAN、clusterW、MEGA等的序列分析与二倍体大白菜共显性标记赋值分析相结合,解决了NTSYS只能认识二元型的0、1数据矩阵,而不能判读基因型数据或者NTSYS、Popgene等都需要将标记检测结果按软件的要求转化为0/1矩阵或者AA/BB字母矩阵的繁琐性问题。本发明方法与NTSYS聚类结果比较基本一致,但省去了NTSYS聚类分析软件的标记文件准备步骤,操作简单,并且该方法适合分析杂交种和纯系之间的关系。
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