一种紧凑型编辑工具EbCas12a在基因编辑中的应用

    公开(公告)号:CN115786305A

    公开(公告)日:2023-03-14

    申请号:CN202211369291.2

    申请日:2022-11-03

    申请人: 武汉大学

    IPC分类号: C12N9/22 C12N15/00

    摘要: 本发明公开了一种紧凑型编辑工具EbCas12a在基因编辑中的应用,属于生物医学领域。所述EbCas12a的氨基酸序列如SED ID NO.1或2所示。本发明首次在Erysipelotrichia bacterium菌株中鉴定出具有基因编辑效应的II类V型更小的CRISPR蛋白EbCas12a(1158AA),比目前报道的具有基因编辑功能的Cas12a均要小;所述EbCas12a能够在crRNA的介导下定点对体外DNA和真核生物基因组进行基因编辑。EbCas12a的发现进一步扩大了基因编辑工具的种类,对基础科研和临床治疗具有十分重要的作用。

    一种Cas12a变体及其在基因编辑中的应用

    公开(公告)号:CN113136376A

    公开(公告)日:2021-07-20

    申请号:CN202110578385.X

    申请日:2021-05-26

    申请人: 武汉大学

    摘要: 本发明提供了一种Cas12a变体及其在基因编辑中的应用,所述Cas12a变体包括如下中的至少一种:Lb2Cas12a‑K518R,氨基酸序列分别如SED ID NO.1所示;LbCas12a‑K538R,氨基酸序列分别如SED ID NO.2所示;AsCas12a‑K548R,氨基酸序列分别如SED ID NO.3所示。本发明首次通过蛋白改造,获得Cas12a变体,使Cas12a的PAM识别相比较对应野生型更严格,从而降低脱靶效应;所述三种Cas12a变体能够在crRNA的介导下定点对真核生物基因组进行基因编辑且具有更低的脱靶效应,三种Cas12a变体的发现进一步扩大了基因编辑工具的种类。

    一种基于代谢组学分析的用于抗氧化衰老药物筛选的大鼠模型的构建方法

    公开(公告)号:CN107247095B

    公开(公告)日:2019-08-20

    申请号:CN201710381294.0

    申请日:2017-05-25

    申请人: 武汉大学

    IPC分类号: G01N30/02 G01N30/06

    摘要: 本发明公开了一种基于代谢组学分析的用于抗氧化衰老药物筛选的大鼠模型的构建方法。采用LC‑MS谱对采集的尿样检测分析;采用PCA、PLS‑DA及OPLS‑DA等技术对正常对照组、模型组、阳性对照组、鞣花酸高剂量组、中剂量组、低剂量组六组大鼠尿液代谢物进行聚类分析,筛选出潜在的生物标志物;运用KEGG数据库进行信号通路分析,用HMDB数据库对代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质进行分析,Met PA网络软件对代谢产物路径进行可视化作图,构建鞣花酸改善D‑型半乳糖致衰老大鼠尿液代谢组学的代谢通路,为抗氧化衰老药物新药的筛选、评价和研发提供代谢组学方法思路。

    一种构建RNA文库的方法和试剂盒
    5.
    发明公开

    公开(公告)号:CN117661124A

    公开(公告)日:2024-03-08

    申请号:CN202311638841.0

    申请日:2023-11-30

    申请人: 武汉大学

    摘要: 本发明提供了一种构建RNA文库的方法,所述方法包括:从RNA样品中富集获得mRNA,所述富集过程中将所述mRNA打断成mRNA小片段;采用第一引物对所述mRNA小片段进行逆转录并纯化,获得第一链cDNA;采用第二引物扩增所述第一链cDNA并纯化,获得第二链cDNA;采用第三引物扩增所述二链cDNA,获得RNA文库;该方法能够简化建库的过程并有效降低建库成本,通过两轮带有接头序列的cDNA的合成,同步完成模板的逆转录和双端接头序列的引入,并完成模板的富集,实现了低成本且快速高效的建库。

    脂滴作为神经退行性疾病药物靶点的用途

    公开(公告)号:CN113730583A

    公开(公告)日:2021-12-03

    申请号:CN202110996135.8

    申请日:2021-08-27

    申请人: 武汉大学

    摘要: 本发明公开了脂滴作为神经退行性疾病药物靶点的用途,本发明首次将脂质液滴积聚小胶质细胞表型转化抑制剂应用于制备用于治疗或预防与神经炎症相关的神经退行性疾病的药物,将脂滴生成抑制剂作为脂质液滴积聚小胶质细胞表型转化抑制剂应用于制备用于治疗或预防与神经炎症相关的神经退行性疾病的药物,并首次以(i)尿石素B或其药学上可接受的盐或(ii)长脂肪酸酰基辅酶A合成酶抑制剂作为脂滴生成抑制剂以及脂质液滴积聚小胶质细胞表型转化抑制剂的有效成分,本发明提供的药物筛选方法首次以脂质液滴积聚小胶质细胞的比例作为药物筛选的指标,能简单、快速、准确地筛选出用于治疗或预防与神经炎症相关的神经退行性疾病的药物。

    II类V型CRISPR蛋白CeCas12a及其在基因编辑的应用

    公开(公告)号:CN111235130A

    公开(公告)日:2020-06-05

    申请号:CN201911119880.3

    申请日:2019-11-15

    申请人: 武汉大学

    摘要: 本发明属于生物医学领域,具体涉及本发明属于生物医学领域,具体涉及一种来自于Coprococcus eutactus细菌中的II类V型CRISPR蛋白CeCas12a及其应用。所述CeCas12a的氨基酸序列如SED ID NO.1所示,其编码核苷酸序列如SED ID NO.2所示。本发明首次在Coprococcus eutactus菌株中鉴定出具有基因编辑效应的II类V型CRISPR蛋白CeCas12a;所述CeCas12a能够在crRNA的介导下定点对原核生物和真核生物基因组进行基因编辑,CeCas12a的发现进一步扩大了基因编辑工具的种类,对基础科研和临床治疗具有十分重要的作用。

    一种肾小球硬化大鼠模型的评价方法

    公开(公告)号:CN107561175A

    公开(公告)日:2018-01-09

    申请号:CN201710681041.5

    申请日:2017-08-10

    申请人: 武汉大学

    IPC分类号: G01N30/02 G06F17/16

    摘要: 本发明公开了一种肾小球硬化大鼠模型的评价方法。本发明首先对第0天、第7天、第10天和第14天收集大鼠模型的尿液分别进行LC-MS测定分析,得出大鼠模型的LC-MS谱图,然后对大鼠模型的LC-MS谱图积分数据矩阵进行多元统计分析,得出大鼠模型的轮廓图,进而对大鼠模型的轮廓图进行轮廓动态分析,得出大鼠模型的轮廓动态变化趋势图,与第0天相比,在模型构建第14天时偏离程度最大;通过Marker view软件分析得出,与第0天相比,在模型构建第14天时的15个生物标志物的含量符合要求,则肾小球硬化大鼠模型构建成功。解决了现有肾小球硬化大鼠模型的构建及评价方法存在精确性低、成本高和费时费力的技术问题。