公开(公告)号：US20060051795A1

公开(公告)日：2006-03-09

申请号：US11203602

申请日：2005-08-15

申请人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  Jon Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

发明人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  Jon Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N15/1031 ,  B01J2219/00689

摘要： Methods of recombining nucleic acids, including homologous nucleic acids, are provided. Families of gene shuffling oligonucleotides and their use in recombination procedures, as well as polymerase and ligase mediated recombination methods are also provided.

公开(公告)号：US20070054313A1

公开(公告)日：2007-03-08

申请号：US11595919

申请日：2006-11-13

申请人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  Jon Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

发明人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  Jon Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12P21/06 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12P21/06

摘要： Methods of recombining nucleic acids, including homologous nucleic acids, are provided. Families of gene shuffling oligonucleotides and their use in recombination procedures, as well as polymerase and ligase mediated recombination methods are also provided.

摘要翻译： 提供重组核酸的方法，包括同源核酸。 还提供了基因改组寡核苷酸家族及其在重组过程中的应用，以及聚合酶和连接酶介导的重组方法。

公开(公告)号：US20070065838A1

公开(公告)日：2007-03-22

申请号：US11277337

申请日：2006-03-23

申请人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  John Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

发明人： Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Jeremy Minshull ,  Steven Bass ,  Mark Welch ,  John Ness ,  Claes Gustafsson ,  Phillip Patten

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B40/02 ,  C40B40/08 ,  C12Q1/68 ,  C12P19/34 ,  C07H21/04 ,  C12N15/86

CPC分类号： C12P21/06

摘要： Methods of recombining nucleic acids, including homologous nucleic acids, are provided. Families of gene shuffling oligonucleotides and their use in recombination procedures, as well as polymerase and ligase mediated recombination methods are also provided.

摘要翻译： 提供重组核酸的方法，包括同源核酸。 还提供了基因改组寡核苷酸家族及其在重组过程中的应用，以及聚合酶和连接酶介导的重组方法。

公开(公告)号：US20080015116A1

公开(公告)日：2008-01-17

申请号：US11677505

申请日：2007-02-21

申请人： Steven Bass ,  S. Davis ,  Phillip Patten ,  Matthew Tobin ,  Jeremy Minshull ,  Mark Welch ,  Claus Gustafsson ,  Brian Carr ,  Stephane Jenne ,  Sun Raillard ,  Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Robin Emig ,  Pascal Longschamp ,  Stanley Goldman ,  Lorraine Giver ,  Joseph Affholter

发明人： Steven Bass ,  S. Davis ,  Phillip Patten ,  Matthew Tobin ,  Jeremy Minshull ,  Mark Welch ,  Claus Gustafsson ,  Brian Carr ,  Stephane Jenne ,  Sun Raillard ,  Andreas Crameri ,  Willem Stemmer ,  Robin Emig ,  Pascal Longschamp ,  Stanley Goldman ,  Lorraine Giver ,  Joseph Affholter

IPC分类号： C40B60/04

CPC分类号： C12N15/1031 ,  B01J19/0046 ,  B01J2219/00378 ,  B01J2219/00585 ,  B01J2219/00659 ,  B01J2219/00675 ,  B01J2219/00689 ,  B01J2219/00695 ,  B01J2219/007 ,  B01J2219/00722 ,  B82Y30/00 ,  C12N15/1027 ,  C40B60/04 ,  G06F19/18 ,  Y02A90/22

摘要： Integrated systems and methods for diversity generation and screening are provided. The systems use common fluid and array handling components to provide nucleic acid diversification, transcription, translation, product screening and subsequent diversification reactions.

摘要翻译： 提供了用于多样化生成和筛选的集成系统和方法。 该系统使用普通液体和阵列处理组分来提供核酸多样化，转录，翻译，产物筛选和随后的多样化反应。

公开(公告)号：US20070048775A1

公开(公告)日：2007-03-01

申请号：US11506142

申请日：2006-08-17

申请人： Stephen Cardayre ,  Matthew Tobin ,  Willem Stemmer ,  Jon Ness ,  Jeremy Minshull ,  Phillip Patten ,  Venkiteswaran Subramanian ,  Linda Castle ,  Claus Krebber ,  Steven Bass ,  Ying-Xin Zhang ,  Tony Cox ,  Gjalt Huisman ,  Ling Yuan ,  Joseph Affholter

发明人： Stephen Cardayre ,  Matthew Tobin ,  Willem Stemmer ,  Jon Ness ,  Jeremy Minshull ,  Phillip Patten ,  Venkiteswaran Subramanian ,  Linda Castle ,  Claus Krebber ,  Steven Bass ,  Ying-Xin Zhang ,  Tony Cox ,  Gjalt Huisman ,  Ling Yuan ,  Joseph Affholter

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B50/06

CPC分类号： C12R1/465 ,  A01K2267/02 ,  C07K14/245 ,  C12N15/1027 ,  C12N15/8271 ,  C12N15/8273 ,  C12N15/8279 ,  C12N15/90 ,  C12P17/162 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/6827

摘要： The invention provides methods employing iterative cycles of recombination and selection/screening for evolution of whole cells and organisms toward acquisition of desired properties. Examples of such properties include enhanced recombinogenicity, genome copy number, and capacity for expression and/or secretion of proteins and secondary metabolites.

公开(公告)号：US20070026446A1

公开(公告)日：2007-02-01

申请号：US11506215

申请日：2006-08-17

申请人： Stephen del Cardayre ,  Matthew Tobin ,  Willem Stemmer ,  Jon Ness ,  Jeremy Minshull ,  Phillip Patten ,  Venkiteswaran Subramanian ,  Linda Castle ,  Claus Krebber ,  Steven Bass ,  Ying-Xin Zhang ,  Tony Cox ,  Gjalt Huisman ,  Ling Yuan ,  Joseph Affholter

发明人： Stephen del Cardayre ,  Matthew Tobin ,  Willem Stemmer ,  Jon Ness ,  Jeremy Minshull ,  Phillip Patten ,  Venkiteswaran Subramanian ,  Linda Castle ,  Claus Krebber ,  Steven Bass ,  Ying-Xin Zhang ,  Tony Cox ,  Gjalt Huisman ,  Ling Yuan ,  Joseph Affholter

IPC分类号： C40B50/06 ,  C40B40/08 ,  A01H1/00

CPC分类号： C12R1/465 ,  A01K2267/02 ,  C07K14/245 ,  C12N15/1027 ,  C12N15/8271 ,  C12N15/8273 ,  C12N15/8279 ,  C12N15/90 ,  C12P17/162 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/6827

摘要： The invention provides methods employing iterative cycles of recombination and selection/screening for evolution of whole cells and organisms toward acquisition of desired properties. Examples of such properties include enhanced recombinogenicity, genome copy number, and capacity for expression and/or secretion of proteins and secondary metabolites.

摘要翻译： 本发明提供了采用迭代循环重组和选择/筛选全细胞和生物体以获得所需性质的方法的方法。 这些性质的实例包括增加的重组原性，基因组拷贝数以及蛋白质和次级代谢物的表达和/或分泌能力。

公开(公告)号：US20060142950A1

公开(公告)日：2006-06-29

申请号：US11339090

申请日：2006-01-24

申请人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine Giver

发明人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine Giver

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/16 ,  B01J2219/007 ,  C40B50/02 ,  G06F19/14 ,  G06F19/18 ,  G06F19/22 ,  G06F19/24

摘要： In silico nucleic acid recombination methods, related integrated systems utilizing genetic operators and libraries made by in silico shuffling methods are provided.

摘要翻译： 在硅胶核酸重组方法中，提供了利用遗传算子和通过计算机改组方法制备的文库的相关综合系统。

公开(公告)号：US20080050782A1

公开(公告)日：2008-02-28

申请号：US11975638

申请日：2007-10-18

申请人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine Giver

发明人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull ,  Lorraine Giver

IPC分类号： C12P19/34 ,  C40B30/02 ,  C40B60/04

CPC分类号： G06F19/16 ,  B01J2219/007 ,  C40B50/02 ,  G06F19/14 ,  G06F19/18 ,  G06F19/22 ,  G06F19/24

摘要： In silico nucleic acid recombination methods, related integrated systems utilizing genetic operators and libraries made by in silico shuffling methods are provided.

公开(公告)号：US20050191688A1

公开(公告)日：2005-09-01

申请号：US11075231

申请日：2005-03-07

申请人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull

发明人： Sergey Selifonov ,  Willem Stemmer ,  Claes Gustafsson ,  Matthew Tobin ,  Stephen del Cardayre ,  Phillip Patten ,  Jeremy Minshull

IPC分类号： A61K39/00 ,  C07K14/16 ,  C07K14/505 ,  C07K14/535 ,  C12N9/16 ,  C12N15/10 ,  C12N15/11 ,  G06F19/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50

CPC分类号： C12N15/1031 ,  A61K39/00 ,  C07K14/005 ,  C07K14/505 ,  C07K14/535 ,  C12N9/16 ,  C12N15/1027 ,  C12N15/11 ,  C12N2740/16122

摘要： “In silico” nucleic acid recombination methods, related integrated systems utilizing genetic operators and libraries made by in silico shuffling methods are provided.

公开(公告)号：US20060257890A1

公开(公告)日：2006-11-16

申请号：US11350407

申请日：2006-02-07

申请人： Jeremy Minshull ,  Willem Stemmer

发明人： Jeremy Minshull ,  Willem Stemmer

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B40/08

CPC分类号： C12N15/1027 ,  C12N15/1058

摘要： The present invention is generally directed to the evolution of new metabolic pathways and the enhancement of bioprocessing through a process herein termed recursive sequence recombination. Recursive sequence recombination entails performing iterative cycles of recombination and screening or selection to “evolve” individual genes, whole plasmids or viruses, multigene clusters, or even whole genomes. Such techniques do not require the extensive analysis and computation required by conventional methods for metabolic engineering.