公开(公告)号：US07811804B2

公开(公告)日：2010-10-12

申请号：US12556528

申请日：2009-09-09

申请人： Grace DeSantis ,  Jay Short ,  Mark Burk ,  Kelvin Wong ,  Kelly Chatman ,  Bob Farwell

发明人： Grace DeSantis ,  Jay Short ,  Mark Burk ,  Kelvin Wong ,  Kelly Chatman ,  Bob Farwell

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12P21/04 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12Q1/00 ,  C07H21/04 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12P7/42 ,  C12P13/002 ,  C12P13/04 ,  C12P41/006 ,  C12Y305/05001 ,  Y02P20/52

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US08334125B2

公开(公告)日：2012-12-18

申请号：US13169853

申请日：2011-06-27

申请人： Grace DeSantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Darcy Madden, legal representative ,  Mark Burk ,  Dan Robertson

发明人： Grace DeSantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Mark Burk ,  Dan Robertson

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12P21/04 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  A61K38/00 ,  C07H21/04 ,  C07H21/02

CPC分类号： C12P7/42 ,  C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/81 ,  C12N15/815 ,  C12P7/40 ,  C12P13/004 ,  C12P13/04 ,  C12P21/00 ,  C12P41/006

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US07993901B2

公开(公告)日：2011-08-09

申请号：US12629818

申请日：2009-12-02

申请人： Grace Desantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Marcy Madden, legal representative ,  Mark Burk ,  Dan Robertson

发明人： Grace Desantis ,  Ellen Chi ,  Jennifer Ann Chaplin ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Mark Burk ,  Dan Robertson

IPC分类号： C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N1/20 ,  C12P21/04 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  A61K38/00 ,  C07H21/04 ,  C07H21/02

CPC分类号： C12P7/42 ,  C12N9/78 ,  C12N15/00 ,  C12N15/70 ,  C12N15/74 ,  C12N15/81 ,  C12N15/815 ,  C12P7/40 ,  C12P13/004 ,  C12P13/04 ,  C12P21/00 ,  C12P41/006

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

摘要翻译： 本发明涉及腈水解酶和编码腈水解酶的核酸。 另外还提​​供了设计新腈水解酶的方法及其使用方法。 在增加的pH和温度下，腈水解酶具有增加的活性和稳定性。

公开(公告)号：US20100273659A1

公开(公告)日：2010-10-28

申请号：US12529340

申请日：2008-02-29

申请人： Grace DeSantis ,  Jennifer Chaplin ,  Ellen Chi ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Darcy Madden ,  Dan Robertson

发明人： Grace DeSantis ,  Jennifer Chaplin ,  Ellen Chi ,  Aileen Milan ,  Jay Short ,  David Weiner ,  Mark Madden ,  Darcy Madden ,  Dan Robertson

IPC分类号： C40B20/00 ,  C12N15/55 ,  C12N15/63 ,  C12N9/78 ,  C12P7/40 ,  C12P7/42 ,  C12P13/00 ,  C12P7/54 ,  C12P7/56 ,  C12P19/34 ,  C12Q1/68 ,  C12P1/00 ,  C12Q1/34

CPC分类号： C12P7/42 ,  C12N9/78 ,  C12P13/002 ,  C12P13/004 ,  C12P13/005 ,  C12P13/04 ,  C12P41/007

摘要： The invention relates to nitrilases and to nucleic acids encoding the nitrilases. In addition methods of designing new nitrilases and method of use thereof are also provided. The nitrilases have increased activity and stability at increased pH and temperature.

公开(公告)号：US20070231820A1

公开(公告)日：2007-10-04

申请号：US11687606

申请日：2007-03-16

申请人： David Weiner ,  Mark Burk ,  Tim Hitchman ,  Catherine Pujol ,  Toby Richardson ,  Jay Short

发明人： David Weiner ,  Mark Burk ,  Tim Hitchman ,  Catherine Pujol ,  Toby Richardson ,  Jay Short

IPC分类号： C12Q1/68 ,  A01H5/00 ,  A01K67/027 ,  C07H21/04 ,  C07H5/04 ,  C07K1/02 ,  C07K1/04 ,  C07K1/06 ,  C07K1/107 ,  C07K1/12 ,  C07K16/40 ,  C12N1/08 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N15/63 ,  C12N5/10 ,  C12N5/12 ,  G06F17/30 ,  G06F17/00 ,  G01N33/573 ,  C12P13/02 ,  C12P21/06 ,  C12P5/00 ,  C12P7/02 ,  C12Q1/26

CPC分类号： C12N9/0071

摘要： The invention is directed to polypeptides having P450 activity, polynucleotides encoding the polypeptides, antibodies that bind to these polypeptides, and methods for making and using these polynucleotides and polypeptides. The P450 enzymes can be used to catalyze the hydrolysis of epoxides and arene oxides to their corresponding diols.

摘要翻译： 本发明涉及具有P450活性的多肽，编码多肽的多核苷酸，与这些多肽结合的抗体，以及制备和使用这些多核苷酸和多肽的方法。 P450酶可用于催化环氧化物和芳烃氧化物水解成其相应的二醇。

公开(公告)号：US20120006716A1

公开(公告)日：2012-01-12

申请号：US13243915

申请日：2011-09-23

申请人： Gerhard Frey ,  Hwai Wen Chang ,  Jay Short

发明人： Gerhard Frey ,  Hwai Wen Chang ,  Jay Short

IPC分类号： B65D85/00 ,  A61K39/395 ,  A61P29/00 ,  A61P21/02 ,  A61P25/04 ,  A61P23/00 ,  A61P25/20 ,  A61P21/00 ,  A61P31/00 ,  A61P17/06 ,  A61P3/10 ,  A61P3/02 ,  A61P5/14 ,  A61P5/00 ,  A61P1/12 ,  A61P11/14 ,  A61P1/08 ,  A61P1/04 ,  A61P1/10 ,  A61P7/02 ,  A61P37/06 ,  A61P5/24 ,  A61P3/00 ,  A61P25/24 ,  A61P25/18 ,  A61P25/22 ,  A61P11/06 ,  A61P23/02 ,  C12P21/02 ,  C07K16/24

CPC分类号： C07K16/248 ,  C07K2317/24 ,  C07K2317/56 ,  C07K2317/73 ,  C07K2317/76 ,  C07K2317/92

摘要： The present invention relates to novel chimeric, humanized or CDR-grafted anti-IL-6 antibodies, including isolated nucleic acids that encode at least one such anti-IL-6 antibody, vectors, host cells, transgenic animals or plants, and methods of making and using thereof, including therapeutic compositions, methods and devices.

摘要翻译： 本发明涉及新颖的嵌合，人源化或CDR移植的抗IL-6抗体，包括编码至少一种这样的抗IL-6抗体，载体，宿主细胞，转基因动物或植物的分离的核酸，以及 包括治疗组合物，方法和装置。

公开(公告)号：US20100209995A1

公开(公告)日：2010-08-19

申请号：US12697907

申请日：2010-02-01

申请人： Walter Callen ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Carl Miller ,  Martin Kazaoka ,  Eric Mathur ,  Jay Short

发明人： Walter Callen ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Carl Miller ,  Martin Kazaoka ,  Eric Mathur ,  Jay Short

IPC分类号： C12N9/26

CPC分类号： C12N9/2411 ,  C12N9/2417 ,  C12P19/14

摘要： In one aspect, the invention is directed to polypeptides having an amylase activity, polynucleotides encoding the polypeptides, and methods for making and using these polynucleotides and polypeptides. In one aspect, the polypeptides of the invention can be used as amylases, for example, alpha amylases, to catalyze the hydrolysis of starch into sugars.

摘要翻译： 一方面，本发明涉及具有淀粉酶活性的多肽，编码多肽的多核苷酸，以及制备和使用这些多核苷酸和多肽的方法。 在一个方面，本发明的多肽可用作淀粉酶，例如α-淀粉酶，以催化淀粉水解成糖。

公开(公告)号：US07459172B2

公开(公告)日：2008-12-02

申请号：US09997807

申请日：2001-11-30

申请人： Jay Short ,  Eric J. Mathur ,  W. Michael Lafferty ,  Nelson Barton ,  Kevin Chow

发明人： Jay Short ,  Eric J. Mathur ,  W. Michael Lafferty ,  Nelson Barton ,  Kevin Chow

IPC分类号： A61K31/74 ,  A61K38/16

CPC分类号： B82Y30/00 ,  A61K9/0092 ,  A61K9/1274 ,  C07K14/195

摘要： A polymer is prepared by self-assembly of a plurality of monomeric polypeptide units. The polymer tends to form a nanotube and is capable of encapsulating a particular drug molecule. Once encapsulated in the polymer of the present invention, the drug molecule may be delivered to a particular location of human body to effectively cure a disease or treat a symptom.Generally, the monomeric polypeptide unit of the present invention has a sequence found in Pyrodictium abyssi, a microorganism that produces an extracellular network having hollow protein tubes, or a sequence substantially identical thereto. The monomeric polypeptide may be mass produced using recombinant biotechnologies and be polymerized into the polymer of the present invention. One or more additional targeting vector may be attached to the monomeric polypeptide unit or the polymer to facilitate the targeting of the drug molecule that may be held there within. The sequence contained in the monomeric polypeptide unit may be further optimized using one or more technique selected from Gene Site Saturation Mutagenesis and GeneReasembly™.

摘要翻译： 通过多个单体多肽单元的自组装制备聚合物。 聚合物倾向于形成纳米管并且能够封装特定的药物分子。 一旦包封在本发明的聚合物中，药物分子可以被递送到人体的特定位置以有效治愈疾病或治疗症状。 通常，本发明的单体多肽单元具有在黑腹果蝇（Pyrodictium abyssi）中发现的序列，该菌株产生具有中空蛋白管的细胞外网络或与其基本相同的序列。 单体多肽可以使用重组生物技术大规模生产并聚合成本发明的聚合物。 一个或多个另外的靶向载体可以连接到单体多肽单元或聚合物，以促进可能在其中保持的药物分子的靶向。 可以使用选自Gene Site Saturation Mutagenesis和GeneReasembly TM的一种或多种技术进一步优化单体多肽单元中所含的序列。

公开(公告)号：US20080032378A1

公开(公告)日：2008-02-07

申请号：US11621534

申请日：2007-01-09

申请人： Walter CALLEN ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Jay Short ,  Eric Mathur ,  Kevin Gray ,  Janne Kerovuo ,  Malgorzata Slupska

发明人： Walter CALLEN ,  Toby Richardson ,  Gerhard Frey ,  Jay Short ,  Eric Mathur ,  Kevin Gray ,  Janne Kerovuo ,  Malgorzata Slupska

IPC分类号： C12N9/26 ,  A01H3/00 ,  C12N1/00 ,  C12N1/21 ,  C12N5/04 ,  C12N5/06 ,  C12N5/10

CPC分类号： C12N9/2417 ,  A21D8/042 ,  C12N9/2414 ,  C12P19/04 ,  C12P19/14 ,  C12Y302/01001 ,  Y02E50/16 ,  Y02E50/17

摘要： This invention relates generally to polypeptides and peptides having an amylase activity, e.g., enzymes, polynucleotides encoding the enzymes, the use of such polypeptides and peptides. In one aspect, the polypeptides having amylase activity have increased activity and stability at acidic, neutral and alkaline pH and increased temperature. In one aspect, the invention provides methods for producing an alcohol, for producing a high-maltose or a high-glucose syrup or a mixed syrup, for liquifying a starch-comprising composition, comprising use of polypeptides having amylase activity of the invention.

摘要翻译： 本发明一般涉及具有淀粉酶活性的多肽和肽，例如酶，编码酶的多核苷酸，这种多肽和肽的用途。 一方面，具有淀粉酶活性的多肽在酸性，中性和碱性pH和升高的温度下具有增加的活性和稳定性。 一方面，本发明提供了用于生产用于液化包含淀粉的组合物的高麦芽糖或高葡萄糖浆或混合糖浆的醇的方法，其包括使用具有本发明的具有淀粉酶活性的多肽。

公开(公告)号：US20050202426A1

公开(公告)日：2005-09-15

申请号：US10491358

申请日：2002-10-01

申请人： Jay Short ,  Martin Latterich ,  Michael Levin ,  Jing Wei ,  Pengcheng Fu

发明人： Jay Short ,  Martin Latterich ,  Michael Levin ,  Jing Wei ,  Pengcheng Fu

IPC分类号： G01N27/62 ,  A61K48/00 ,  B01J20/281 ,  B01J20/285 ,  C07K1/16 ,  C12N1/15 ,  C12N1/21 ,  C12N5/10 ,  C12N15/09 ,  C12N15/85 ,  C12Q1/00 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/68 ,  G01N27/64 ,  G01N30/04 ,  G01N30/06 ,  G01N30/26 ,  G01N30/34 ,  G01N30/46 ,  G01N30/60 ,  G01N30/72 ,  G01N30/84 ,  G01N30/86 ,  G01N30/88 ,  G01N31/00 ,  G01N31/22 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G01N33/569 ,  G01N33/58 ,  G01N33/68 ,  G06F19/00

CPC分类号： G01N33/56911 ,  G01N33/5091

摘要： The invention provides methods for whole cell engineering of new and modified phenotypes by using “on-line” or “real-time” metabolic flux analysis. The invention provides a method for whole cell engineering of new or modified phenotypes by using real-time metabolic flux analysis by making a modified cell by modifying the genetic composition of a cell and culturing the modified cell to generate a plurality of modified cells and measuring at least one metabolic parameter of the cell by monitoring the cell culture of in real time. The invention also provides articles comprising machine-readable medium including machine-executable instructions and systems, e.g., computer systems, to practice the methods of the invention.

摘要翻译： 本发明通过使用“在线”或“实时”代谢通量分析提供新的和修饰的表型的全细胞工程的方法。 本发明提供了一种通过使用实时代谢通量分析通过改变细胞的遗传组成并培养修饰的细胞以产生多个修饰的细胞并通过在 通过实时监测细胞培养物，细胞的至少一种代谢参数。 本发明还提供包括机器可读介质的文章，其包括机器可执行指令和系统，例如计算机系统，以实施本发明的方法。