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    Method of modeling complex formation between a query ligan and a target molecule
    1.
    发明授权
    Method of modeling complex formation between a query ligan and a target molecule 有权
    建立查询结构与目标分子之间的复合物形成的方法

    公开(公告)号：US07826979B2

    公开(公告)日：2010-11-02

    申请号：US10781015

    申请日：2004-02-17

    申请人： Guy Bemis ,  Paul Caron ,  Brian Hare ,  W. Patrick Walters

    发明人： Guy Bemis ,  Paul Caron ,  Brian Hare ,  W. Patrick Walters

    IPC分类号： G01N33/48 ,  C12Q1/68

    CPC分类号： G06F19/706 ,  G06F19/16

    摘要： Computer-based methods for modeling complex formation between a query ligand and a target macromolecule are described herein. The methods can include, for example, providing a structural model of a query ligand and a structural model of a target macromolecule; identifying a substructure of the query ligand; identifying comparison ligands in a set of 3-D structural models that each share an identical substructure with the query ligand, wherein each 3-D structural model comprises a comparison ligand and a comparison macromolecule, and wherein the comparison macromolecule has structural features homologous to the target macromolecule; mapping spatial relationships between the substructure atoms of the query ligand and the comparison ligand such that corresponding atoms are identified; assigning atomic coordinates to the corresponding atoms of the query ligand; and generating one or more output models, each model comprising a 3-D structural model of the query ligand substructure and the target macromolecule. Related articles and apparatuses are also described.

    摘要翻译： 本文描述了用于建模查询配体和目标大分子之间的复合物形成的基于计算机的方法。 该方法可以包括例如提供查询配体的结构模型和目标大分子的结构模型; 鉴定查询配体的子结构; 鉴定一组3-D结构模型中的比较配体，其每个结构模型与查询配体共享相同的子结构，其中每个3-D结构模型包含比较配体和比较大分子，并且其中所述比较大分子具有与 目标大分子; 绘制查询配体的子结构原子与比较配体之间的空间关系，以便确定相应的原子; 将原子坐标指定给查询配体的相应原子; 并产生一个或多个输出模型，每个模型包括查询配体子结构和目标大分子的3-D结构模型。 还描述了相关的物品和装置。

    Heterocyclic inhibitors of p38
    9.
    发明授权
    Heterocyclic inhibitors of p38 有权
    p38的杂环抑制剂

    公开(公告)号：US06509363B2

    公开(公告)日：2003-01-21

    申请号：US09809854

    申请日：2001-03-16

    申请人： Francesco Salituro ,  Guy Bemis ,  John Cochran

    发明人： Francesco Salituro ,  Guy Bemis ,  John Cochran

    IPC分类号： A61K31421

    CPC分类号： C07D233/88 ,  C07D263/48 ,  C07D277/48

    摘要： The present invention relates to inhibitors of p38, a mammalian protein kinase involved cell proliferation, cell death and response to extracellular stimuli. The invention also relates to methods for producing these inhibitors. The invention also provides pharmaceutical compositions comprising the inhibitors of the invention and methods of utilizing those compositions in the treatment and prevention of various disorders.

    摘要翻译： 本发明涉及p38的抑制剂，哺乳动物蛋白激酶涉及细胞增殖，细胞死亡和对细胞外刺激的反应。 本发明还涉及生产这些抑制剂的方法。 本发明还提供包含本发明抑制剂的药物组合物和利用这些组合物治疗和预防各种疾病的方法。