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    Crystal structure of WW domains and methods of use thereof
    8.
    发明授权
    Crystal structure of WW domains and methods of use thereof 有权
    WW域的晶体结构及其使用方法

    公开(公告)号：US07127357B1

    公开(公告)日：2006-10-24

    申请号：US09733773

    申请日：2000-12-08

    申请人： Joseph P. Noel ,  Mark A. Verdecia

    发明人： Joseph P. Noel ,  Mark A. Verdecia

    IPC分类号： G06N3/00 ,  G06N7/00 ,  G06G7/58

    CPC分类号： G06F19/16 ,  G06F19/18

    摘要： A WW domain crystal structure of Pin1 is provided. In addition, methods of using the crystal structure and atomic coordinates for the development of WW domain binding agents is also provided. Also provided are computer programs on computer readable medium for use in developing WW domain binding agents.

    摘要翻译： 提供了Pin1的WW域晶体结构。 此外，还提供了使用晶体结构和原子坐标来开发WW结构域结合剂的方法。 还提供了用于开发WW域结合剂的计算机可读介质上的计算机程序。

    Structure of the farnesoid X receptor ligand binding domain and methods of use therefor
    9.
    发明授权
    Structure of the farnesoid X receptor ligand binding domain and methods of use therefor 失效
    法呢酯X受体配体结合域的结构及其用途

    公开(公告)号：US08212006B2

    公开(公告)日：2012-07-03

    申请号：US12686347

    申请日：2010-01-12

    申请人： Michael R. Downes ,  Mark A. Verdicia ,  Joseph P. Noel ,  Ronald M. Evans ,  Lindsey J. Bowman ,  Marianne Bowman

    发明人： Michael R. Downes ,  Mark A. Verdicia ,  Joseph P. Noel ,  Ronald M. Evans ,  Lindsey J. Bowman ,  Marianne Bowman

    IPC分类号： C07K1/00 ,  G06G7/58 ,  A01N61/00

    CPC分类号： C07K14/70567 ,  C07K2299/00 ,  G01N33/743 ,  G01N2500/00 ,  G06F19/16 ,  G06F19/706

    摘要： The present invention provides compositions comprising the ligand binding domain (LBD) of a farnesoid X receptor (FXR) in crystalline form. In alternative embodiments, the LBD of FXR is complexed with a ligand therefor. There are provided high resolution structures of FXR complexed with a novel high affinity agonist fexaramine. The discovered structure of a FXR LBD provides the first three-dimensional view of the structural basis for FXR ligand binding. The present invention further provides a computer for producing a time-dimensional representation of FXR or a complex thereof, and a computer for determining at least a portion of the structure coordinates of FXR or a complex thereof. The present invention further provides methods of using this structural information to predict molecules capable of binding to FXR; to identify compounds with agonist, antagonist or partial agonist activity for FXR; and to determine whether a test compound is capable of binding to the LBD of FXR. The present invention further provides compositions comprising compounds identified by such invention methods.

    摘要翻译： 本发明提供了包含结晶形式的法呢甾X受体（FXR）的配体结合结构域（LBD）的组合物。 在替代实施方案中，FXR的LBD与其配体复合。 提供了与新型高亲和力激动剂福沙康胺复合的FXR的高分辨率结构。 所发现的FXR LBD的结构提供了FXR配体结合的结构基础的第一个三维视图。 本发明还提供一种用于产生FXR或其复数的时间维度表示的计算机，以及用于确定FXR或其复数的结构坐标的至少一部分的计算机。 本发明还提供使用该结构信息来预测能够结合FXR的分子的方法; 识别FXR激动剂，拮抗剂或部分激动剂活性的化合物; 并确定测试化合物是否能够结合FXR的LBD。 本发明还提供包含通过本发明方法鉴定的化合物的组合物。