本发明属于医用口腔根管治疗材料领域，特别涉及一种纳米氧化锌丁香油根管充填材料及其制备方法。该充填材料的化学组成为粉剂占60%～75%，丁香油占25%～40%；其中：粉剂的化学组成(重量%)为：无机成分纳米ZnO46%～90%，粒径为10～280nm；无机成分纳米ZrO25%～40%，其粒径为10～600nm；无机成分纳米羟基磷灰石≤10%，粒径为80～100nm；其粒径为90～150nm；无机成分纳米载银抗菌粉≤10%，其粒径为90～150nm；麝香草酚2%～10%，抗厌氧菌药物≤10%，抗生素≤25%，类固醇糖皮质激素＜1%。本发明与现有技术相比制备的充填材料具有较好的X射线阻射性、流动性、生物相容性、溶解性低、抗菌效率高、价格低廉的优点。