本发明涉及一种荧光PCR微流控芯片微流体荧光测速控速装置及方法，属于生物学和分析化学及医学检测领域。包括有光源(1)、激发光分光系统(2)、发射光分光系统(4)、流速调控执行元件、与计算机相连接的光电检测器(3)、丝杠和与丝杠相连接的步进电机。在生物PCR荧光微流控芯片的每个微通道的同一位置设置有检测点。激发光光纤传导系统和发射光光纤传导系统均固定在丝杠上，计算机通过步进电机控制丝杠移动，流速调控执行元件的输入端与计算机相连接，输出端与生物PCR微流控芯片的微通道相连接。通过本装置可以测量每个微通道的流速，计算机通过实际流速与理论流速的差值，能够通过流速调控执行元件调控下一个微通道的流速。