本发明公开了一种奶山羊MFG-E8基因单核苷酸的多态性及其检测方法，以包含MFG-E8基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P(包括P1，R1，newP)为引物，PCR扩增奶山羊MFG-E8基因；用限制性内切酶EcoRV消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳；根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定奶山羊MFG-E8基因第12892nt的单核苷酸多态性；由于MFG-E8基因功能涉及乳腺发育，乳脂和总固形物等奶成分，本发明提供的检测方法为MFG-E8基因的SNP与奶成分关系的建立奠定了基础，以便用于中国奶山羊奶用性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的奶山羊种群。