本发明公开一种处理铜冶金流程中含氯酸性废水的离子交换膜电解方法，采用非均相阳离子交换膜隔开阴极室和阳极室的溶液，阳极为钌铱系涂层钛网（板）或石墨电极等惰性电极中的一种，阴极为石墨电极、铜电极、钛电极或不锈钢电极中的一种，电解温度为25~65℃，电流密度为100~1000A/m2，通过电解，含氯酸性废水中的有价金属如铜、硒、碲、锑、铋、铅、砷、银和金等均富集在阴极沉积物中，总回收率≥80%；氯离子在阳极氧化成氯气予以脱除和回收，处理液最终以高浓度硫酸形式实现回用，硫酸回收率≥95%，回用的硫酸中氯离子含量≤500mg/L。