本发明公开了一种短期风电功率预测系统的综合误差修正方法，该方法包括风电场功率输出环节误差修正和数值天气预报环节误差修正，风电场功率输出环节误差修正步骤，计算功率输出模型的最佳建模粒度，用多台风机建模替代单机建模后累加，利用倍方差法剔除功率输出模型散点图上的异常数据点，利用相关因子修正功率输出模型的系统误差。数值天气预报环节误差修正步骤，通过对比实测风速和不同时空发生数值天气预报风速的相关系数和系统误差修正，得到主导数值天气预报风速序列，利用相关性分析法校正冷锋到达的时滞误差。本发明针对现有短期风电功率预测系统输入数据质量较低的问题，对于各类短期风电功率预测方法，具有普遍适用性，且便于应用于工程实际，能显著提高短期风电功率预测的建模精度和预测精度。