本发明公开了一种双机主备裁决的方法及系统。通过多线程技术对宿主机指定的应用软件心跳信息、以太网卡状态和串口通信设备状态进行不间断的实时监测，并依据监测结果生成状态报告，依据预先设定的配置文件内容在启动阶段启动对应的裁决模式执行代码，所述裁决模式包括双控器模式、直连模式和单机模式；根据所属裁决模式执行代码选择相应的裁决模式，并根据本机状态、对等机状态、双控器判决结果或人工设定进行综合运算，裁决宿主机的主备状态。本发明实施例能够在一个裁决软件中集成系统运行状态监测功能和多种主备裁决的功能，同时优化裁决算法，弥补上述两种通用裁决方式的不足。