本发明公开了一种全水溶脱氟硝基氮磷钾多元肥的生产方法，它是基于冷冻法硝酸磷肥的工艺流程，在硝酸钙过滤与母液中和步骤之间增加了母液脱氟和母液深度除钙，母液脱氟通过向母液添加硝酸钾，使母液中的氟硅酸离子和钾离子反应生成氟硅酸钾结晶，反应后的料浆经过滤分离出副产品氟硅酸钾；母液深度除钙通过向母液添加硫酸钾，母液的钙离子和硫酸根离子生成硫酸钙结晶，经固液分离得到不含钙的中和母液，在中和过程添加硝酸钾、硝酸铵、微量元素等，经后续步骤处理即制得全水溶脱氟硝基氮磷钾多元肥。本发明既回收利用了氟资源，得到了副产品氟硅酸钾，也减少了氟对环境的污染，并且避免了中和过程磷酸盐沉淀的生成，确保了全水溶肥的产品品质。