本发明涉及一种基于自适应算法的非自航船舶智能移位系统及移位方法，所述系统包括控制单元和与控制单元相连的GPS模块、锚机及变频器，所述锚机的数量至少为2，分别设置于船舶的不同位置，锚机分别通过缆绳与独立的锚点连接；所述方法包括GPS定位、在施工图纸上加载大地坐标系、船舶移位等步骤，本发明使GPS模块的实时定位信息与施工图纸上的目标位置信息有机结合，确保了船舶位移符合施工要求，自适应算法可以及时对外界因素的干扰进行修正，实现了移船过程的自动化，使船舶及时在受风、浪等荷载作用和潮位涨落的影响下也能自动调整船舶的运动，应用该系统的船舶的移船过程自动完成，在节省人力资源成本的同时提升了移船的速度和精度。