本发明涉及一种高效液相色谱峰保留时间预测方法。该方法包括：测定各种样品的各种成分的标准保留时间，在每个样品的目标成分中选择两个成分作为该样品的双标对照成分，获得双标对照成分在待测样品的供试品溶液中的实测保留时间，获得其他目标成分的实测保留时间，进行两点验证和多点验证等步骤。采用本发明提供的高效液相色谱峰保留时间预测方法能够准确预测待测样品的各种成分的色谱峰的保留时间，进而对待测样品的色谱峰进行定性，进行待测样品的鉴别。本发明所提供的方法具有较高的预测精度，适用的色谱柱数量多，明显优于现有的相对保留时间法。