本发明涉及生物技术领域，公开了一种生产辅酶Q10工程菌的构建方法、工程菌与应用方法，构建方法如下：a.从类球红细菌中提取基因组DNA；b.用聚合酶链式反应扩增出bchG的同源基因；c.用扩增出的同源基因与广宿主质粒连接，构建重组载体；d.重组载体转化至大肠杆菌S17-1中；e.将大肠杆菌S17-1与所述类球红细菌接合转移，即得敲除了叶绿素合成基因bchG的工程菌。本发明提供一种通过敲除类球红细菌叶绿素合成基因提高辅酶Q10产量的方法，能将辅酶Q10的合成能力提高约15%，适合辅酶Q10的大规模工业化生产。