本发明提供一种冷轧热镀锌镀层均匀度的偏差值控制方法，包括以下步骤：1）建立刀唇开度对镀层厚度的影响模型；2）建立决定每一个气刀刀唇伺服电机调整量对各个镀层影响权值的影响效率函数矩阵；3）根据二次型误差函数最小原则求解电机调整量；4）考虑实际应用特征修正二次型误差函数，当某点镀锌厚度测量值偏移大部分的测量点时，为了避免极端值的干扰影响其它区域的镀层控制，在误差函数中增加了一项过滤函数，最后得到所需的气刀唇开度。本发明提出了新的适应工业应用的镀锌层厚度计算模型，引入影响效率函数矩阵，提高了镀层均匀度控制精度，同时增加成本函数和过滤函数项，提高了镀层误差函数精度，从而提高了镀层均匀度计算精度，使镀锌产品表面质量得以改善。