本发明公开了一种对Szorb装置中补充的氢气脱除水分的方法，包括顺序相接的如下步骤：A、在压力小于11MPa、温度不超过110℃的条件下，对补充的氢气脱游离水，得夹带饱和水的氢气；B、在压力小于11MPa、温度不超过110℃的条件下，脱除步骤A中所得夹带饱和水的氢气中的饱和水，得到净化的补充氢气。本发明对Szorb装置中补充的氢气脱除水分的方法，所用装置投资成本低，占地面积小，分离效能提高，故障率低，设备免维护，补充氢气效果好，有效解决了氢气带水、干燥吸附器使用周期短等问题可连续使用4年以上，避免了补充氢气压缩机由于带液引起的不正常振动和电流过大现象，提高了其安全稳定性，同时降低了能耗。