一种基于神经网络的锅炉燃烧智能控制系统及方法，该控制系统包括DCS侧人机交互接口、双向控制通讯链路和智能燃烧控制系统主机；双向控制通讯链路采用双路冗余配置，将智能燃烧控制系统主机与电站固有DCS系统连接，电站固有DCS系统内通过组态画面及逻辑设置，配置DCS侧人机交互接口；本发明还提供了控制方法；充分利用锅炉燃烧调整原理和经验，避免过分依赖样本数量的问题，将氧量给定、各层二次风门开度、燃尽风门开度都纳入在线燃烧优化的控制范围，实现炉侧的全面闭环控制。此外，由于锅炉系统涉及设备和工况繁多，在出现特殊情况，使燃烧优化的个别控制回路需切换为手动并进行人工干预时，该系统仍能对剩余控制回路进行优化，提高系统的工况适应能力。