本发明公开了一种空调控制系统及其控制空调运行的方法，所述方法包括：空调控制系统在调控开始时间到达后，监测电网调度系统的电网负荷，并根据监测的电网负荷确定出电网负荷高峰期的电网控制策略；对于电网控制策略所涉及的每个被控空调，控制该被控空调转入降负荷运行状态，以降低电网调度系统的电网负荷，并获取该被控空调的当前运行状态作为该被控空调的调控前运行状态，并对其进行记录；在调控结束时间到达后，每隔设定时间段对一组被控空调进行解控恢复操作：对于该组被控空调中的每个被控空调，根据记录的该被控空调的调控前运行状态，控制该被控空调转入其调控前运行状态。应用本发明可以避免电网受到较大冲击，并保证用户正常用电。