本发明涉及一种磁导航智能车的交叉路口及通行方法，交叉路口建于多条交叉道路的交汇处，包括环形轨道、通信基站和磁道钉，所述的环形轨道采用双车道，包括外环形道路和内环形道路，所述的通信基站设置在内环形道路的中心部分，连接远程监控服务器，所述的磁道钉铺设于交叉道路和环形轨道的路面上；通行方法采用磁道钉编码实现车辆在交叉路径处的准确定位，通过通信基站进行车辆调度及解决紧急停车的情况，使磁导航智能车顺利完成全程行驶。与现有技术相比，本发明的通用性和扩展性好，有效规避车辆的启停动作和远程监控中心的复杂调度，节约能源的同时大幅提升智能交通系统的运行效率。