本发明公开了一种用于发酵产氢的拜氏梭菌及其发酵方法和应用，该菌保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏号为CGMCC NO.9411。培养时先将该菌株的冻存液进行厌氧培养，得到培养好的菌株培养菌液，将菌株培养液离心后重悬菌体，得到的重悬菌液作为接种菌源，将接种菌源接入产氢培养液中在恒温水浴摇床上无光培养产氢，直至产氢结束。该菌株可利用自然界常见且难以被大多数微生物利用的碳源及氮源发酵制氢，在发酵制氢的同时会生产乙醇及丁醇等生物燃料。是目前报道的首例多功能型新型拜氏梭菌菌株；可应用于生物质发酵产氢、乙醇丁醇生物燃料生产等，具有广泛的应用前景。