本发明公开了一种三绕组变压器损耗在线测量系统，该系统包括用于测量三绕组变压器电压和电流的电压互感器和电流互感器，所述的电压互感器和电流互感器的输出端与采集卡相连，采集卡将采集的电压/电流信号经过A/D转换后，根据互感器校准数据进行修正，计算相电压/相电流，通过快速傅里叶变换，得到三绕组三相的电流和电压的基波分量和各谐波分量后根据损耗公式进行损耗的计算，本发明能够在变压器内部参数未知的情况下，在线测量三绕组变压器损耗，具备9路电压信号及9路电流信号的同步采集、保存、分析及处理能力，能够对由互感器精度及角差、二次信号传输干扰、谐波等因素导致的测量误差进行有效补偿、校正。